Protein–RNA interactions for Protein: P86448

Trim43b, Tripartite motif-containing protein 43B, mousemouse

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim43bP86448 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Trim43bP86448 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Trim43bP86448 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Trim43bP86448 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Trim43bP86448 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Trim43bP86448 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Trim43bP86448 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Trim43bP86448 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Trim43bP86448 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Trim43bP86448 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Trim43bP86448 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Trim43bP86448 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Trim43bP86448 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
Trim43bP86448 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Trim43bP86448 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Trim43bP86448 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Trim43bP86448 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Trim43bP86448 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Trim43bP86448 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Trim43bP86448 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Trim43bP86448 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Trim43bP86448 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Trim43bP86448 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Trim43bP86448 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Trim43bP86448 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Trim43bP86448 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Trim43bP86448 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Trim43bP86448 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
Trim43bP86448 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Trim43bP86448 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Trim43bP86448 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Trim43bP86448 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Trim43bP86448 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Trim43bP86448 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Trim43bP86448 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Trim43bP86448 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Trim43bP86448 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Trim43bP86448 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Trim43bP86448 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Trim43bP86448 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Trim43bP86448 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Trim43bP86448 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Trim43bP86448 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Trim43bP86448 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Trim43bP86448 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Trim43bP86448 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Trim43bP86448 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Trim43bP86448 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Trim43bP86448 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Trim43bP86448 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Trim43bP86448 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Trim43bP86448 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Trim43bP86448 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Trim43bP86448 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Trim43bP86448 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Trim43bP86448 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Trim43bP86448 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Trim43bP86448 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Trim43bP86448 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Trim43bP86448 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Trim43bP86448 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Trim43bP86448 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Trim43bP86448 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Trim43bP86448 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Trim43bP86448 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Trim43bP86448 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Trim43bP86448 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Trim43bP86448 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Trim43bP86448 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Trim43bP86448 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Trim43bP86448 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Trim43bP86448 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Trim43bP86448 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Trim43bP86448 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Trim43bP86448 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Trim43bP86448 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Trim43bP86448 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Trim43bP86448 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Trim43bP86448 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Trim43bP86448 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Trim43bP86448 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Trim43bP86448 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Trim43bP86448 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Trim43bP86448 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Trim43bP86448 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Trim43bP86448 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Trim43bP86448 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Trim43bP86448 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Trim43bP86448 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Trim43bP86448 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Trim43bP86448 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Trim43bP86448 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Trim43bP86448 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Trim43bP86448 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Trim43bP86448 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Trim43bP86448 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Trim43bP86448 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Trim43bP86448 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Trim43bP86448 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Trim43bP86448 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.9 ms