Protein–RNA interactions for Protein: P70408

Cdh10, Cadherin-10, mousemouse

Predictions only

Length 788 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdh10P70408 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cdh10P70408 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cdh10P70408 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cdh10P70408 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cdh10P70408 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cdh10P70408 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cdh10P70408 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cdh10P70408 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cdh10P70408 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cdh10P70408 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cdh10P70408 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cdh10P70408 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cdh10P70408 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cdh10P70408 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cdh10P70408 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cdh10P70408 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cdh10P70408 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cdh10P70408 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cdh10P70408 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cdh10P70408 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Cdh10P70408 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cdh10P70408 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cdh10P70408 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cdh10P70408 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cdh10P70408 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cdh10P70408 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cdh10P70408 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Cdh10P70408 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cdh10P70408 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cdh10P70408 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cdh10P70408 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cdh10P70408 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cdh10P70408 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cdh10P70408 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cdh10P70408 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Cdh10P70408 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Cdh10P70408 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cdh10P70408 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cdh10P70408 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cdh10P70408 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cdh10P70408 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cdh10P70408 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cdh10P70408 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cdh10P70408 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cdh10P70408 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cdh10P70408 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cdh10P70408 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cdh10P70408 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cdh10P70408 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cdh10P70408 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cdh10P70408 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cdh10P70408 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cdh10P70408 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cdh10P70408 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cdh10P70408 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cdh10P70408 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cdh10P70408 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cdh10P70408 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Cdh10P70408 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cdh10P70408 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cdh10P70408 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cdh10P70408 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cdh10P70408 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Cdh10P70408 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Cdh10P70408 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC21.33■■□□□ 1
Cdh10P70408 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Cdh10P70408 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cdh10P70408 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cdh10P70408 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cdh10P70408 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Cdh10P70408 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cdh10P70408 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cdh10P70408 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cdh10P70408 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cdh10P70408 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Cdh10P70408 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cdh10P70408 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cdh10P70408 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cdh10P70408 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cdh10P70408 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Cdh10P70408 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cdh10P70408 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cdh10P70408 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Cdh10P70408 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Cdh10P70408 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cdh10P70408 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Cdh10P70408 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cdh10P70408 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Cdh10P70408 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Cdh10P70408 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cdh10P70408 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cdh10P70408 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cdh10P70408 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cdh10P70408 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cdh10P70408 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cdh10P70408 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cdh10P70408 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cdh10P70408 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Cdh10P70408 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cdh10P70408 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.4 ms