Protein–RNA interactions for Protein: P70354

Msx3, Homeobox protein MSX-3, mousemouse

Predictions only

Length 204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msx3P70354 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Msx3P70354 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Msx3P70354 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Msx3P70354 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Msx3P70354 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Msx3P70354 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Msx3P70354 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Msx3P70354 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Msx3P70354 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Msx3P70354 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Msx3P70354 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Msx3P70354 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Msx3P70354 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Msx3P70354 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Msx3P70354 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Msx3P70354 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Msx3P70354 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Msx3P70354 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Msx3P70354 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Msx3P70354 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Msx3P70354 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Msx3P70354 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Msx3P70354 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Msx3P70354 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Msx3P70354 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Msx3P70354 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Msx3P70354 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Msx3P70354 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Msx3P70354 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Msx3P70354 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Msx3P70354 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Msx3P70354 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Msx3P70354 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Msx3P70354 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Msx3P70354 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Msx3P70354 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Msx3P70354 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Msx3P70354 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Msx3P70354 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Msx3P70354 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Msx3P70354 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Msx3P70354 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Msx3P70354 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Msx3P70354 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Msx3P70354 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Msx3P70354 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Msx3P70354 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Msx3P70354 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Msx3P70354 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Msx3P70354 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Msx3P70354 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Msx3P70354 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Msx3P70354 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Msx3P70354 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Msx3P70354 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Msx3P70354 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Msx3P70354 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Msx3P70354 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Msx3P70354 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Msx3P70354 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Msx3P70354 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Msx3P70354 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Msx3P70354 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Msx3P70354 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Msx3P70354 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Msx3P70354 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Msx3P70354 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Msx3P70354 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Msx3P70354 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Msx3P70354 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Msx3P70354 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Msx3P70354 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Msx3P70354 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Msx3P70354 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Msx3P70354 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Msx3P70354 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Msx3P70354 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Msx3P70354 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Msx3P70354 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Msx3P70354 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Msx3P70354 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Msx3P70354 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
Msx3P70354 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Msx3P70354 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Msx3P70354 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Msx3P70354 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Msx3P70354 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Msx3P70354 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Msx3P70354 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Msx3P70354 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Msx3P70354 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Msx3P70354 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Msx3P70354 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Msx3P70354 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
Msx3P70354 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Msx3P70354 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Msx3P70354 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Msx3P70354 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Msx3P70354 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Msx3P70354 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms