Protein–RNA interactions for Protein: P70338

Gfi1, Zinc finger protein Gfi-1, mousemouse

Predictions only

Length 423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfi1P70338 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gfi1P70338 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gfi1P70338 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gfi1P70338 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gfi1P70338 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gfi1P70338 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gfi1P70338 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gfi1P70338 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gfi1P70338 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gfi1P70338 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gfi1P70338 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gfi1P70338 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gfi1P70338 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gfi1P70338 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gfi1P70338 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gfi1P70338 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gfi1P70338 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gfi1P70338 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gfi1P70338 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gfi1P70338 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gfi1P70338 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gfi1P70338 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gfi1P70338 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gfi1P70338 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gfi1P70338 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gfi1P70338 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gfi1P70338 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gfi1P70338 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gfi1P70338 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gfi1P70338 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gfi1P70338 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gfi1P70338 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gfi1P70338 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gfi1P70338 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Gfi1P70338 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Gfi1P70338 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gfi1P70338 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gfi1P70338 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gfi1P70338 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gfi1P70338 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gfi1P70338 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gfi1P70338 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gfi1P70338 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gfi1P70338 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Gfi1P70338 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gfi1P70338 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gfi1P70338 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Gfi1P70338 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Gfi1P70338 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gfi1P70338 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gfi1P70338 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gfi1P70338 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gfi1P70338 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gfi1P70338 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gfi1P70338 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gfi1P70338 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gfi1P70338 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gfi1P70338 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gfi1P70338 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gfi1P70338 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gfi1P70338 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gfi1P70338 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gfi1P70338 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gfi1P70338 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gfi1P70338 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gfi1P70338 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Gfi1P70338 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Gfi1P70338 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gfi1P70338 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gfi1P70338 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gfi1P70338 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gfi1P70338 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gfi1P70338 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gfi1P70338 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gfi1P70338 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gfi1P70338 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gfi1P70338 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Gfi1P70338 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gfi1P70338 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gfi1P70338 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gfi1P70338 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gfi1P70338 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gfi1P70338 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gfi1P70338 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gfi1P70338 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gfi1P70338 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gfi1P70338 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gfi1P70338 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gfi1P70338 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gfi1P70338 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gfi1P70338 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Gfi1P70338 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gfi1P70338 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gfi1P70338 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gfi1P70338 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gfi1P70338 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gfi1P70338 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gfi1P70338 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gfi1P70338 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.15
Gfi1P70338 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms