Protein–RNA interactions for Protein: P70268

Pkn1, Serine/threonine-protein kinase N1, mousemouse

Predictions only

Length 946 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkn1P70268 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
Pkn1P70268 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Pkn1P70268 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
Pkn1P70268 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Pkn1P70268 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Pkn1P70268 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Pkn1P70268 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Pkn1P70268 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Pkn1P70268 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Pkn1P70268 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Pkn1P70268 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Pkn1P70268 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Pkn1P70268 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Pkn1P70268 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Pkn1P70268 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Pkn1P70268 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Pkn1P70268 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
Pkn1P70268 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Pkn1P70268 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Pkn1P70268 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Pkn1P70268 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Pkn1P70268 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
Pkn1P70268 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.68
Pkn1P70268 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Pkn1P70268 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Pkn1P70268 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Pkn1P70268 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Pkn1P70268 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Pkn1P70268 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Pkn1P70268 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Pkn1P70268 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Pkn1P70268 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Pkn1P70268 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Pkn1P70268 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Pkn1P70268 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Pkn1P70268 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Pkn1P70268 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
Pkn1P70268 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Pkn1P70268 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Pkn1P70268 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Pkn1P70268 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Pkn1P70268 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Pkn1P70268 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Pkn1P70268 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Pkn1P70268 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Pkn1P70268 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Pkn1P70268 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Pkn1P70268 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Pkn1P70268 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Pkn1P70268 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Pkn1P70268 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Pkn1P70268 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Pkn1P70268 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Pkn1P70268 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Pkn1P70268 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Pkn1P70268 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Pkn1P70268 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Pkn1P70268 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Pkn1P70268 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Pkn1P70268 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Pkn1P70268 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Pkn1P70268 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Pkn1P70268 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Pkn1P70268 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Pkn1P70268 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Pkn1P70268 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Pkn1P70268 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Pkn1P70268 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Pkn1P70268 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Pkn1P70268 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Pkn1P70268 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Pkn1P70268 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Pkn1P70268 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Pkn1P70268 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Pkn1P70268 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Pkn1P70268 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Pkn1P70268 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Pkn1P70268 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Pkn1P70268 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Pkn1P70268 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Pkn1P70268 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Pkn1P70268 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Pkn1P70268 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Pkn1P70268 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Pkn1P70268 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Pkn1P70268 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Pkn1P70268 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Pkn1P70268 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Pkn1P70268 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Pkn1P70268 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Pkn1P70268 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Pkn1P70268 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Pkn1P70268 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Pkn1P70268 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Pkn1P70268 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Pkn1P70268 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Pkn1P70268 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Pkn1P70268 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Pkn1P70268 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Pkn1P70268 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.4 ms