Protein–RNA interactions for Protein: P70213

Fv1, Friend virus susceptibility protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 459 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fv1P70213 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Fv1P70213 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Fv1P70213 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Fv1P70213 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Fv1P70213 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Fv1P70213 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Fv1P70213 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Fv1P70213 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Fv1P70213 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Fv1P70213 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Fv1P70213 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Fv1P70213 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Fv1P70213 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Fv1P70213 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Fv1P70213 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Fv1P70213 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Fv1P70213 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Fv1P70213 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Fv1P70213 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Fv1P70213 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Fv1P70213 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Fv1P70213 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Fv1P70213 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Fv1P70213 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Fv1P70213 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Fv1P70213 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Fv1P70213 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Fv1P70213 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Fv1P70213 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Fv1P70213 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Fv1P70213 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Fv1P70213 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Fv1P70213 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Fv1P70213 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Fv1P70213 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Fv1P70213 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Fv1P70213 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Fv1P70213 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Fv1P70213 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Fv1P70213 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Fv1P70213 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Fv1P70213 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Fv1P70213 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Fv1P70213 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Fv1P70213 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Fv1P70213 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Fv1P70213 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Fv1P70213 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Fv1P70213 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Fv1P70213 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Fv1P70213 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Fv1P70213 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Fv1P70213 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Fv1P70213 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Fv1P70213 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Fv1P70213 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Fv1P70213 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Fv1P70213 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Fv1P70213 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Fv1P70213 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Fv1P70213 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Fv1P70213 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Fv1P70213 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Fv1P70213 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Fv1P70213 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Fv1P70213 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Fv1P70213 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Fv1P70213 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Fv1P70213 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Fv1P70213 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Fv1P70213 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Fv1P70213 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Fv1P70213 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Fv1P70213 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Fv1P70213 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Fv1P70213 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Fv1P70213 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Fv1P70213 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Fv1P70213 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Fv1P70213 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Fv1P70213 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Fv1P70213 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Fv1P70213 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Fv1P70213 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Fv1P70213 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Fv1P70213 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Fv1P70213 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Fv1P70213 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Fv1P70213 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Fv1P70213 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Fv1P70213 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Fv1P70213 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Fv1P70213 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Fv1P70213 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Fv1P70213 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Fv1P70213 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Fv1P70213 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Fv1P70213 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Fv1P70213 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Fv1P70213 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.8 ms