Protein–RNA interactions for Protein: P70193

Lrig1, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,091 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrig1P70193 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lrig1P70193 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lrig1P70193 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Lrig1P70193 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Lrig1P70193 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Lrig1P70193 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Lrig1P70193 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Lrig1P70193 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lrig1P70193 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lrig1P70193 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lrig1P70193 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lrig1P70193 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lrig1P70193 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lrig1P70193 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lrig1P70193 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lrig1P70193 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Lrig1P70193 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Lrig1P70193 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Lrig1P70193 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Lrig1P70193 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Lrig1P70193 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Lrig1P70193 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Lrig1P70193 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Lrig1P70193 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lrig1P70193 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lrig1P70193 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lrig1P70193 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lrig1P70193 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Lrig1P70193 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Lrig1P70193 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Lrig1P70193 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Lrig1P70193 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Lrig1P70193 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Lrig1P70193 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lrig1P70193 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lrig1P70193 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lrig1P70193 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lrig1P70193 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lrig1P70193 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lrig1P70193 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lrig1P70193 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Lrig1P70193 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Lrig1P70193 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Lrig1P70193 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Lrig1P70193 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Lrig1P70193 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Lrig1P70193 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Lrig1P70193 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Lrig1P70193 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Lrig1P70193 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Lrig1P70193 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Lrig1P70193 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Lrig1P70193 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Lrig1P70193 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Lrig1P70193 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Lrig1P70193 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Lrig1P70193 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Lrig1P70193 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Lrig1P70193 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Lrig1P70193 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Lrig1P70193 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Lrig1P70193 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Lrig1P70193 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Lrig1P70193 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Lrig1P70193 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Lrig1P70193 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Lrig1P70193 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Lrig1P70193 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Lrig1P70193 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Lrig1P70193 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Lrig1P70193 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Lrig1P70193 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Lrig1P70193 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Lrig1P70193 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Lrig1P70193 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
Lrig1P70193 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Lrig1P70193 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Lrig1P70193 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Lrig1P70193 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Lrig1P70193 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Lrig1P70193 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Lrig1P70193 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Lrig1P70193 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Lrig1P70193 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Lrig1P70193 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Lrig1P70193 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Lrig1P70193 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Lrig1P70193 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Lrig1P70193 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Lrig1P70193 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Lrig1P70193 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Lrig1P70193 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Lrig1P70193 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Lrig1P70193 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Lrig1P70193 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Lrig1P70193 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Lrig1P70193 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Lrig1P70193 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Lrig1P70193 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Lrig1P70193 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms