Protein–RNA interactions for Protein: P62956

Cacng7, Voltage-dependent calcium channel gamma-7 subunit, mousemouse

Predictions only

Length 275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacng7P62956 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC17,53■□□□□ 0,4
Cacng7P62956 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,53■□□□□ 0,4
Cacng7P62956 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,53■□□□□ 0,4
Cacng7P62956 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17,53■□□□□ 0,4
Cacng7P62956 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,53■□□□□ 0,4
Cacng7P62956 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,53■□□□□ 0,4
Cacng7P62956 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17,52■□□□□ 0,4
Cacng7P62956 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17,52■□□□□ 0,4
Cacng7P62956 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC17,52■□□□□ 0,4
Cacng7P62956 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,52■□□□□ 0,39
Cacng7P62956 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,52■□□□□ 0,39
Cacng7P62956 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,52■□□□□ 0,39
Cacng7P62956 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC17,51■□□□□ 0,39
Cacng7P62956 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC17,51■□□□□ 0,39
Cacng7P62956 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,5■□□□□ 0,39
Cacng7P62956 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,5■□□□□ 0,39
Cacng7P62956 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC17,5■□□□□ 0,39
Cacng7P62956 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,5■□□□□ 0,39
Cacng7P62956 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,49■□□□□ 0,39
Cacng7P62956 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC17,48■□□□□ 0,39
Cacng7P62956 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17,48■□□□□ 0,39
Cacng7P62956 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC17,48■□□□□ 0,39
Cacng7P62956 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,48■□□□□ 0,39
Cacng7P62956 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC17,47■□□□□ 0,39
Cacng7P62956 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC17,47■□□□□ 0,39
Cacng7P62956 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC17,47■□□□□ 0,39
Cacng7P62956 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,47■□□□□ 0,39
Cacng7P62956 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,47■□□□□ 0,39
Cacng7P62956 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17,46■□□□□ 0,39
Cacng7P62956 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,46■□□□□ 0,39
Cacng7P62956 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC17,46■□□□□ 0,39
Cacng7P62956 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,45■□□□□ 0,38
Cacng7P62956 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,45■□□□□ 0,38
Cacng7P62956 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC17,45■□□□□ 0,38
Cacng7P62956 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,45■□□□□ 0,38
Cacng7P62956 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17,44■□□□□ 0,38
Cacng7P62956 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17,44■□□□□ 0,38
Cacng7P62956 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17,43■□□□□ 0,38
Cacng7P62956 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17,43■□□□□ 0,38
Cacng7P62956 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17,43■□□□□ 0,38
Cacng7P62956 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC17,43■□□□□ 0,38
Cacng7P62956 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17,43■□□□□ 0,38
Cacng7P62956 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17,43■□□□□ 0,38
Cacng7P62956 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC17,42■□□□□ 0,38
Cacng7P62956 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17,42■□□□□ 0,38
Cacng7P62956 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,42■□□□□ 0,38
Cacng7P62956 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17,42■□□□□ 0,38
Cacng7P62956 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,42■□□□□ 0,38
Cacng7P62956 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,42■□□□□ 0,38
Cacng7P62956 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,42■□□□□ 0,38
Cacng7P62956 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC17,41■□□□□ 0,38
Cacng7P62956 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17,41■□□□□ 0,38
Cacng7P62956 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,41■□□□□ 0,38
Cacng7P62956 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,41■□□□□ 0,38
Cacng7P62956 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,41■□□□□ 0,38
Cacng7P62956 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17,4■□□□□ 0,38
Cacng7P62956 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17,4■□□□□ 0,38
Cacng7P62956 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,4■□□□□ 0,38
Cacng7P62956 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17,4■□□□□ 0,38
Cacng7P62956 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC17,4■□□□□ 0,38
Cacng7P62956 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,4■□□□□ 0,38
Cacng7P62956 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17,4■□□□□ 0,38
Cacng7P62956 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17,4■□□□□ 0,38
Cacng7P62956 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC17,4■□□□□ 0,38
Cacng7P62956 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,39■□□□□ 0,38
Cacng7P62956 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC17,39■□□□□ 0,38
Cacng7P62956 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC17,39■□□□□ 0,38
Cacng7P62956 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,39■□□□□ 0,37
Cacng7P62956 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17,39■□□□□ 0,37
Cacng7P62956 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17,39■□□□□ 0,37
Cacng7P62956 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17,38■□□□□ 0,37
Cacng7P62956 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC17,38■□□□□ 0,37
Cacng7P62956 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,38■□□□□ 0,37
Cacng7P62956 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC17,38■□□□□ 0,37
Cacng7P62956 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,38■□□□□ 0,37
Cacng7P62956 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC17,38■□□□□ 0,37
Cacng7P62956 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17,38■□□□□ 0,37
Cacng7P62956 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,38■□□□□ 0,37
Cacng7P62956 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17,38■□□□□ 0,37
Cacng7P62956 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17,37■□□□□ 0,37
Cacng7P62956 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17,37■□□□□ 0,37
Cacng7P62956 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,37■□□□□ 0,37
Cacng7P62956 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,37■□□□□ 0,37
Cacng7P62956 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17,37■□□□□ 0,37
Cacng7P62956 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,37■□□□□ 0,37
Cacng7P62956 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17,37■□□□□ 0,37
Cacng7P62956 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17,37■□□□□ 0,37
Cacng7P62956 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17,37■□□□□ 0,37
Cacng7P62956 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,37■□□□□ 0,37
Cacng7P62956 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC17,36■□□□□ 0,37
Cacng7P62956 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,36■□□□□ 0,37
Cacng7P62956 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17,36■□□□□ 0,37
Cacng7P62956 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC17,36■□□□□ 0,37
Cacng7P62956 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,35■□□□□ 0,37
Cacng7P62956 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,35■□□□□ 0,37
Cacng7P62956 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC17,35■□□□□ 0,37
Cacng7P62956 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17,35■□□□□ 0,37
Cacng7P62956 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17,34■□□□□ 0,37
Cacng7P62956 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,34■□□□□ 0,37
Cacng7P62956 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC17,34■□□□□ 0,37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19,6 ms