Protein–RNA interactions for Protein: P62858

Rps28, 40S ribosomal protein S28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 69 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps28P62858 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14,35□□□□□ -0,11
Rps28P62858 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14,34□□□□□ -0,11
Rps28P62858 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14,34□□□□□ -0,11
Rps28P62858 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14,34□□□□□ -0,11
Rps28P62858 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14,34□□□□□ -0,11
Rps28P62858 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC14,33□□□□□ -0,11
Rps28P62858 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14,33□□□□□ -0,11
Rps28P62858 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14,33□□□□□ -0,12
Rps28P62858 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14,32□□□□□ -0,12
Rps28P62858 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14,32□□□□□ -0,12
Rps28P62858 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC14,31□□□□□ -0,12
Rps28P62858 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC14,31□□□□□ -0,12
Rps28P62858 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14,31□□□□□ -0,12
Rps28P62858 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14,3□□□□□ -0,12
Rps28P62858 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14,3□□□□□ -0,12
Rps28P62858 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14,3□□□□□ -0,12
Rps28P62858 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC14,3□□□□□ -0,12
Rps28P62858 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14,29□□□□□ -0,12
Rps28P62858 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14,29□□□□□ -0,12
Rps28P62858 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14,28□□□□□ -0,12
Rps28P62858 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC14,28□□□□□ -0,12
Rps28P62858 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14,28□□□□□ -0,12
Rps28P62858 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14,28□□□□□ -0,12
Rps28P62858 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14,28□□□□□ -0,12
Rps28P62858 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC14,28□□□□□ -0,12
Rps28P62858 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14,27□□□□□ -0,12
Rps28P62858 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC14,27□□□□□ -0,12
Rps28P62858 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14,27□□□□□ -0,12
Rps28P62858 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC14,27□□□□□ -0,13
Rps28P62858 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14,27□□□□□ -0,13
Rps28P62858 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC14,27□□□□□ -0,13
Rps28P62858 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14,27□□□□□ -0,13
Rps28P62858 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14,27□□□□□ -0,13
Rps28P62858 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14,27□□□□□ -0,13
Rps28P62858 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14,26□□□□□ -0,13
Rps28P62858 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14,26□□□□□ -0,13
Rps28P62858 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14,26□□□□□ -0,13
Rps28P62858 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14,26□□□□□ -0,13
Rps28P62858 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14,26□□□□□ -0,13
Rps28P62858 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14,26□□□□□ -0,13
Rps28P62858 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14,25□□□□□ -0,13
Rps28P62858 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14,25□□□□□ -0,13
Rps28P62858 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14,25□□□□□ -0,13
Rps28P62858 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14,24□□□□□ -0,13
Rps28P62858 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14,23□□□□□ -0,13
Rps28P62858 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14,23□□□□□ -0,13
Rps28P62858 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14,23□□□□□ -0,13
Rps28P62858 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14,23□□□□□ -0,13
Rps28P62858 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC14,23□□□□□ -0,13
Rps28P62858 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC14,23□□□□□ -0,13
Rps28P62858 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14,23□□□□□ -0,13
Rps28P62858 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC14,21□□□□□ -0,13
Rps28P62858 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14,21□□□□□ -0,13
Rps28P62858 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14,21□□□□□ -0,13
Rps28P62858 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC14,21□□□□□ -0,13
Rps28P62858 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC14,21□□□□□ -0,13
Rps28P62858 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC14,21□□□□□ -0,13
Rps28P62858 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14,21□□□□□ -0,14
Rps28P62858 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14,2□□□□□ -0,14
Rps28P62858 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14,2□□□□□ -0,14
Rps28P62858 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC14,19□□□□□ -0,14
Rps28P62858 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC14,19□□□□□ -0,14
Rps28P62858 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14,19□□□□□ -0,14
Rps28P62858 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC14,18□□□□□ -0,14
Rps28P62858 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14,18□□□□□ -0,14
Rps28P62858 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC14,18□□□□□ -0,14
Rps28P62858 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14,17□□□□□ -0,14
Rps28P62858 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14,17□□□□□ -0,14
Rps28P62858 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC14,17□□□□□ -0,14
Rps28P62858 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14,17□□□□□ -0,14
Rps28P62858 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14,17□□□□□ -0,14
Rps28P62858 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14,17□□□□□ -0,14
Rps28P62858 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14,17□□□□□ -0,14
Rps28P62858 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC14,16□□□□□ -0,14
Rps28P62858 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC14,16□□□□□ -0,14
Rps28P62858 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14,16□□□□□ -0,14
Rps28P62858 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14,15□□□□□ -0,14
Rps28P62858 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14,15□□□□□ -0,14
Rps28P62858 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14,15□□□□□ -0,14
Rps28P62858 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14,15□□□□□ -0,14
Rps28P62858 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14,14□□□□□ -0,15
Rps28P62858 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14,14□□□□□ -0,15
Rps28P62858 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC14,13□□□□□ -0,15
Rps28P62858 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14,13□□□□□ -0,15
Rps28P62858 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14,13□□□□□ -0,15
Rps28P62858 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14,13□□□□□ -0,15
Rps28P62858 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC14,12□□□□□ -0,15
Rps28P62858 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14,12□□□□□ -0,15
Rps28P62858 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC14,12□□□□□ -0,15
Rps28P62858 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14,12□□□□□ -0,15
Rps28P62858 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14,11□□□□□ -0,15
Rps28P62858 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC14,11□□□□□ -0,15
Rps28P62858 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14,11□□□□□ -0,15
Rps28P62858 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14,11□□□□□ -0,15
Rps28P62858 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14,1□□□□□ -0,15
Rps28P62858 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14,1□□□□□ -0,15
Rps28P62858 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14,1□□□□□ -0,15
Rps28P62858 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14,1□□□□□ -0,15
Rps28P62858 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14,09□□□□□ -0,15
Rps28P62858 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14,09□□□□□ -0,15
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