Protein–RNA interactions for Protein: P62320

Snrpd3, Small nuclear ribonucleoprotein Sm D3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snrpd3P62320 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Snrpd3P62320 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Snrpd3P62320 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Snrpd3P62320 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Snrpd3P62320 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Snrpd3P62320 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Snrpd3P62320 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Snrpd3P62320 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Snrpd3P62320 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Snrpd3P62320 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Snrpd3P62320 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Snrpd3P62320 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Snrpd3P62320 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Snrpd3P62320 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Snrpd3P62320 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Snrpd3P62320 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Snrpd3P62320 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Snrpd3P62320 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Snrpd3P62320 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Snrpd3P62320 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Snrpd3P62320 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Snrpd3P62320 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Snrpd3P62320 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Snrpd3P62320 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Snrpd3P62320 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Snrpd3P62320 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Snrpd3P62320 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Snrpd3P62320 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Snrpd3P62320 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Snrpd3P62320 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Snrpd3P62320 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Snrpd3P62320 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Snrpd3P62320 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Snrpd3P62320 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Snrpd3P62320 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Snrpd3P62320 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Snrpd3P62320 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Snrpd3P62320 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Snrpd3P62320 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Snrpd3P62320 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Snrpd3P62320 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Snrpd3P62320 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Snrpd3P62320 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Snrpd3P62320 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Snrpd3P62320 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Snrpd3P62320 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Snrpd3P62320 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Snrpd3P62320 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Snrpd3P62320 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Snrpd3P62320 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Snrpd3P62320 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Snrpd3P62320 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Snrpd3P62320 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Snrpd3P62320 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Snrpd3P62320 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Snrpd3P62320 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Snrpd3P62320 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Snrpd3P62320 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Snrpd3P62320 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Snrpd3P62320 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Snrpd3P62320 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Snrpd3P62320 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Snrpd3P62320 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Snrpd3P62320 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Snrpd3P62320 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Snrpd3P62320 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Snrpd3P62320 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.42
Snrpd3P62320 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Snrpd3P62320 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Snrpd3P62320 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Snrpd3P62320 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Snrpd3P62320 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Snrpd3P62320 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Snrpd3P62320 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Snrpd3P62320 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Snrpd3P62320 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Snrpd3P62320 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Snrpd3P62320 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Snrpd3P62320 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Snrpd3P62320 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Snrpd3P62320 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Snrpd3P62320 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Snrpd3P62320 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Snrpd3P62320 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Snrpd3P62320 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Snrpd3P62320 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Snrpd3P62320 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Snrpd3P62320 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Snrpd3P62320 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Snrpd3P62320 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Snrpd3P62320 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Snrpd3P62320 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Snrpd3P62320 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Snrpd3P62320 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Snrpd3P62320 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Snrpd3P62320 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Snrpd3P62320 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Snrpd3P62320 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Snrpd3P62320 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Snrpd3P62320 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms