Protein–RNA interactions for Protein: P61202

Cops2, COP9 signalosome complex subunit 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 443 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cops2P61202 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cops2P61202 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cops2P61202 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cops2P61202 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Cops2P61202 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Cops2P61202 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Cops2P61202 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cops2P61202 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cops2P61202 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cops2P61202 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cops2P61202 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Cops2P61202 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cops2P61202 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Cops2P61202 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cops2P61202 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cops2P61202 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cops2P61202 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cops2P61202 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cops2P61202 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cops2P61202 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Cops2P61202 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Cops2P61202 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Cops2P61202 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Cops2P61202 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Cops2P61202 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cops2P61202 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cops2P61202 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cops2P61202 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cops2P61202 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Cops2P61202 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Cops2P61202 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Cops2P61202 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Cops2P61202 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Cops2P61202 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cops2P61202 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cops2P61202 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Cops2P61202 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Cops2P61202 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Cops2P61202 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cops2P61202 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cops2P61202 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cops2P61202 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cops2P61202 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cops2P61202 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cops2P61202 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cops2P61202 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cops2P61202 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cops2P61202 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cops2P61202 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Cops2P61202 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cops2P61202 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cops2P61202 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cops2P61202 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cops2P61202 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cops2P61202 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cops2P61202 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cops2P61202 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cops2P61202 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cops2P61202 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cops2P61202 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cops2P61202 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cops2P61202 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cops2P61202 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cops2P61202 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cops2P61202 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cops2P61202 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cops2P61202 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cops2P61202 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cops2P61202 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cops2P61202 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cops2P61202 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cops2P61202 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cops2P61202 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Cops2P61202 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Cops2P61202 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Cops2P61202 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Cops2P61202 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Cops2P61202 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Cops2P61202 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cops2P61202 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cops2P61202 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cops2P61202 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cops2P61202 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cops2P61202 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cops2P61202 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cops2P61202 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cops2P61202 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cops2P61202 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cops2P61202 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cops2P61202 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cops2P61202 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cops2P61202 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cops2P61202 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cops2P61202 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cops2P61202 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cops2P61202 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cops2P61202 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cops2P61202 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cops2P61202 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cops2P61202 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.1 ms