Protein–RNA interactions for Protein: P59470

Polr3b, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC2, mousemouse

Predictions only

Length 1,133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr3bP59470 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Polr3bP59470 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Polr3bP59470 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Polr3bP59470 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Polr3bP59470 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Polr3bP59470 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Polr3bP59470 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Polr3bP59470 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Polr3bP59470 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Polr3bP59470 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Polr3bP59470 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Polr3bP59470 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Polr3bP59470 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Polr3bP59470 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Polr3bP59470 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Polr3bP59470 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Polr3bP59470 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Polr3bP59470 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Polr3bP59470 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Polr3bP59470 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Polr3bP59470 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Polr3bP59470 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Polr3bP59470 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Polr3bP59470 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Polr3bP59470 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Polr3bP59470 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Polr3bP59470 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Polr3bP59470 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Polr3bP59470 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Polr3bP59470 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Polr3bP59470 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Polr3bP59470 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Polr3bP59470 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Polr3bP59470 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Polr3bP59470 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Polr3bP59470 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Polr3bP59470 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Polr3bP59470 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Polr3bP59470 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Polr3bP59470 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Polr3bP59470 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Polr3bP59470 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Polr3bP59470 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Polr3bP59470 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Polr3bP59470 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Polr3bP59470 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Polr3bP59470 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Polr3bP59470 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Polr3bP59470 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Polr3bP59470 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Polr3bP59470 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Polr3bP59470 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Polr3bP59470 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Polr3bP59470 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Polr3bP59470 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Polr3bP59470 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Polr3bP59470 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Polr3bP59470 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Polr3bP59470 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Polr3bP59470 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Polr3bP59470 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Polr3bP59470 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Polr3bP59470 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Polr3bP59470 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Polr3bP59470 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Polr3bP59470 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Polr3bP59470 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Polr3bP59470 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Polr3bP59470 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Polr3bP59470 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Polr3bP59470 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Polr3bP59470 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Polr3bP59470 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Polr3bP59470 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Polr3bP59470 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Polr3bP59470 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Polr3bP59470 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Polr3bP59470 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Polr3bP59470 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Polr3bP59470 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Polr3bP59470 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Polr3bP59470 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Polr3bP59470 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Polr3bP59470 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Polr3bP59470 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Polr3bP59470 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Polr3bP59470 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Polr3bP59470 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Polr3bP59470 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Polr3bP59470 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Polr3bP59470 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Polr3bP59470 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Polr3bP59470 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Polr3bP59470 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Polr3bP59470 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Polr3bP59470 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Polr3bP59470 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Polr3bP59470 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Polr3bP59470 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Polr3bP59470 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.8 ms