Protein–RNA interactions for Protein: P59240

Nphp4, Nephrocystin-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nphp4P59240 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
Nphp4P59240 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
Nphp4P59240 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
Nphp4P59240 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33■■■□□ 2.87
Nphp4P59240 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC33■■■□□ 2.87
Nphp4P59240 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.99■■■□□ 2.87
Nphp4P59240 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC32.99■■■□□ 2.87
Nphp4P59240 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC32.98■■■□□ 2.87
Nphp4P59240 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
Nphp4P59240 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.97■■■□□ 2.87
Nphp4P59240 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC32.97■■■□□ 2.87
Nphp4P59240 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
Nphp4P59240 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC32.96■■■□□ 2.87
Nphp4P59240 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.96■■■□□ 2.87
Nphp4P59240 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
Nphp4P59240 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.86
Nphp4P59240 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
Nphp4P59240 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.94■■■□□ 2.86
Nphp4P59240 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC32.94■■■□□ 2.86
Nphp4P59240 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC32.92■■■□□ 2.86
Nphp4P59240 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC32.92■■■□□ 2.86
Nphp4P59240 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
Nphp4P59240 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
Nphp4P59240 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
Nphp4P59240 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
Nphp4P59240 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC32.9■■■□□ 2.86
Nphp4P59240 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
Nphp4P59240 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
Nphp4P59240 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.89■■■□□ 2.86
Nphp4P59240 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC32.89■■■□□ 2.86
Nphp4P59240 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.85
Nphp4P59240 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
Nphp4P59240 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
Nphp4P59240 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
Nphp4P59240 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
Nphp4P59240 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
Nphp4P59240 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
Nphp4P59240 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.82■■■□□ 2.84
Nphp4P59240 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
Nphp4P59240 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
Nphp4P59240 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
Nphp4P59240 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
Nphp4P59240 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
Nphp4P59240 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC32.79■■■□□ 2.84
Nphp4P59240 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
Nphp4P59240 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
Nphp4P59240 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC32.78■■■□□ 2.84
Nphp4P59240 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
Nphp4P59240 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC32.77■■■□□ 2.84
Nphp4P59240 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
Nphp4P59240 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
Nphp4P59240 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.75■■■□□ 2.83
Nphp4P59240 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC32.74■■■□□ 2.83
Nphp4P59240 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
Nphp4P59240 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
Nphp4P59240 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
Nphp4P59240 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
Nphp4P59240 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
Nphp4P59240 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
Nphp4P59240 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
Nphp4P59240 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC32.73■■■□□ 2.83
Nphp4P59240 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
Nphp4P59240 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
Nphp4P59240 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
Nphp4P59240 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
Nphp4P59240 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
Nphp4P59240 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
Nphp4P59240 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
Nphp4P59240 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC32.68■■■□□ 2.82
Nphp4P59240 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
Nphp4P59240 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC32.68■■■□□ 2.82
Nphp4P59240 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
Nphp4P59240 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
Nphp4P59240 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.65■■■□□ 2.82
Nphp4P59240 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
Nphp4P59240 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC32.65■■■□□ 2.82
Nphp4P59240 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
Nphp4P59240 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
Nphp4P59240 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC32.64■■■□□ 2.82
Nphp4P59240 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.63■■■□□ 2.81
Nphp4P59240 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC32.63■■■□□ 2.81
Nphp4P59240 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC32.62■■■□□ 2.81
Nphp4P59240 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
Nphp4P59240 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC32.61■■■□□ 2.81
Nphp4P59240 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC32.61■■■□□ 2.81
Nphp4P59240 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.61■■■□□ 2.81
Nphp4P59240 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
Nphp4P59240 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC32.6■■■□□ 2.81
Nphp4P59240 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC32.6■■■□□ 2.81
Nphp4P59240 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
Nphp4P59240 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.6■■■□□ 2.81
Nphp4P59240 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
Nphp4P59240 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
Nphp4P59240 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC32.59■■■□□ 2.81
Nphp4P59240 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
Nphp4P59240 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
Nphp4P59240 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
Nphp4P59240 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
Nphp4P59240 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
Nphp4P59240 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.56■■■□□ 2.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms