Protein–RNA interactions for Protein: P58196

Plscr4, Phospholipid scramblase 4, mousemouse

Predictions only

Length 326 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plscr4P58196 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Plscr4P58196 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Plscr4P58196 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Plscr4P58196 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Plscr4P58196 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Plscr4P58196 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Plscr4P58196 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Plscr4P58196 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Plscr4P58196 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Plscr4P58196 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Plscr4P58196 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Plscr4P58196 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Plscr4P58196 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Plscr4P58196 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Plscr4P58196 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Plscr4P58196 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Plscr4P58196 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Plscr4P58196 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Plscr4P58196 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Plscr4P58196 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Plscr4P58196 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Plscr4P58196 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Plscr4P58196 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Plscr4P58196 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Plscr4P58196 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Plscr4P58196 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Plscr4P58196 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Plscr4P58196 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Plscr4P58196 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Plscr4P58196 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Plscr4P58196 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Plscr4P58196 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Plscr4P58196 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Plscr4P58196 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Plscr4P58196 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Plscr4P58196 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Plscr4P58196 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Plscr4P58196 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Plscr4P58196 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Plscr4P58196 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Plscr4P58196 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Plscr4P58196 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Plscr4P58196 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Plscr4P58196 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Plscr4P58196 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Plscr4P58196 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Plscr4P58196 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Plscr4P58196 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Plscr4P58196 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Plscr4P58196 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Plscr4P58196 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Plscr4P58196 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Plscr4P58196 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Plscr4P58196 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Plscr4P58196 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Plscr4P58196 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Plscr4P58196 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Plscr4P58196 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Plscr4P58196 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Plscr4P58196 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Plscr4P58196 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Plscr4P58196 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Plscr4P58196 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Plscr4P58196 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Plscr4P58196 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Plscr4P58196 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Plscr4P58196 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Plscr4P58196 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Plscr4P58196 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Plscr4P58196 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Plscr4P58196 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Plscr4P58196 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Plscr4P58196 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Plscr4P58196 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Plscr4P58196 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Plscr4P58196 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Plscr4P58196 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Plscr4P58196 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Plscr4P58196 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Plscr4P58196 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Plscr4P58196 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Plscr4P58196 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Plscr4P58196 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Plscr4P58196 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Plscr4P58196 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Plscr4P58196 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Plscr4P58196 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Plscr4P58196 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Plscr4P58196 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Plscr4P58196 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Plscr4P58196 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Plscr4P58196 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Plscr4P58196 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Plscr4P58196 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Plscr4P58196 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Plscr4P58196 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Plscr4P58196 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Plscr4P58196 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Plscr4P58196 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Plscr4P58196 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms