Protein–RNA interactions for Protein: P56959

Fus, RNA-binding protein FUS, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 518 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FusP56959 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
FusP56959 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
FusP56959 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
FusP56959 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
FusP56959 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
FusP56959 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
FusP56959 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
FusP56959 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
FusP56959 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
FusP56959 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
FusP56959 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
FusP56959 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
FusP56959 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
FusP56959 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
FusP56959 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
FusP56959 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
FusP56959 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
FusP56959 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
FusP56959 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
FusP56959 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
FusP56959 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
FusP56959 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
FusP56959 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
FusP56959 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
FusP56959 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
FusP56959 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
FusP56959 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
FusP56959 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
FusP56959 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
FusP56959 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
FusP56959 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
FusP56959 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
FusP56959 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
FusP56959 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
FusP56959 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
FusP56959 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
FusP56959 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
FusP56959 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
FusP56959 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
FusP56959 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
FusP56959 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
FusP56959 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
FusP56959 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
FusP56959 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
FusP56959 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
FusP56959 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
FusP56959 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
FusP56959 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
FusP56959 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
FusP56959 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
FusP56959 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
FusP56959 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
FusP56959 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
FusP56959 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
FusP56959 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
FusP56959 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
FusP56959 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
FusP56959 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
FusP56959 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
FusP56959 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
FusP56959 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
FusP56959 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
FusP56959 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
FusP56959 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
FusP56959 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
FusP56959 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
FusP56959 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
FusP56959 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
FusP56959 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
FusP56959 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
FusP56959 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
FusP56959 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
FusP56959 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
FusP56959 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
FusP56959 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
FusP56959 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
FusP56959 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
FusP56959 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
FusP56959 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
FusP56959 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
FusP56959 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
FusP56959 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
FusP56959 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
FusP56959 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
FusP56959 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
FusP56959 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
FusP56959 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
FusP56959 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
FusP56959 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
FusP56959 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
FusP56959 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
FusP56959 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
FusP56959 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
FusP56959 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
FusP56959 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
FusP56959 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
FusP56959 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
FusP56959 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
FusP56959 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
FusP56959 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 116.6 ms