Protein–RNA interactions for Protein: P56480

Atp5b, ATP synthase subunit beta, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 529 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp5bP56480 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Atp5bP56480 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Atp5bP56480 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Atp5bP56480 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Atp5bP56480 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Atp5bP56480 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Atp5bP56480 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Atp5bP56480 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Atp5bP56480 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Atp5bP56480 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Atp5bP56480 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Atp5bP56480 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Atp5bP56480 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Atp5bP56480 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Atp5bP56480 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Atp5bP56480 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Atp5bP56480 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Atp5bP56480 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Atp5bP56480 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Atp5bP56480 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Atp5bP56480 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Atp5bP56480 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Atp5bP56480 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Atp5bP56480 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Atp5bP56480 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Atp5bP56480 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Atp5bP56480 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Atp5bP56480 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Atp5bP56480 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Atp5bP56480 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Atp5bP56480 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Atp5bP56480 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Atp5bP56480 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Atp5bP56480 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Atp5bP56480 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Atp5bP56480 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Atp5bP56480 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Atp5bP56480 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Atp5bP56480 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Atp5bP56480 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Atp5bP56480 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Atp5bP56480 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Atp5bP56480 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Atp5bP56480 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Atp5bP56480 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Atp5bP56480 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Atp5bP56480 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Atp5bP56480 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Atp5bP56480 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Atp5bP56480 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Atp5bP56480 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Atp5bP56480 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Atp5bP56480 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Atp5bP56480 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Atp5bP56480 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Atp5bP56480 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Atp5bP56480 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Atp5bP56480 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Atp5bP56480 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Atp5bP56480 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Atp5bP56480 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Atp5bP56480 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Atp5bP56480 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Atp5bP56480 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Atp5bP56480 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Atp5bP56480 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Atp5bP56480 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Atp5bP56480 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Atp5bP56480 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Atp5bP56480 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Atp5bP56480 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Atp5bP56480 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Atp5bP56480 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Atp5bP56480 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Atp5bP56480 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Atp5bP56480 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Atp5bP56480 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Atp5bP56480 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Atp5bP56480 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Atp5bP56480 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Atp5bP56480 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Atp5bP56480 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Atp5bP56480 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Atp5bP56480 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Atp5bP56480 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Atp5bP56480 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Atp5bP56480 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Atp5bP56480 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Atp5bP56480 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Atp5bP56480 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Atp5bP56480 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Atp5bP56480 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Atp5bP56480 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Atp5bP56480 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Atp5bP56480 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Atp5bP56480 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Atp5bP56480 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Atp5bP56480 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Atp5bP56480 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Atp5bP56480 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms