Protein–RNA interactions for Protein: P56183

Rrp1, Ribosomal RNA processing protein 1 homolog A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrp1P56183 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Rrp1P56183 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Rrp1P56183 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Rrp1P56183 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Rrp1P56183 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Rrp1P56183 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Rrp1P56183 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Rrp1P56183 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Rrp1P56183 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Rrp1P56183 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Rrp1P56183 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Rrp1P56183 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Rrp1P56183 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Rrp1P56183 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Rrp1P56183 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Rrp1P56183 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Rrp1P56183 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Rrp1P56183 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Rrp1P56183 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Rrp1P56183 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Rrp1P56183 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Rrp1P56183 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Rrp1P56183 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Rrp1P56183 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Rrp1P56183 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Rrp1P56183 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Rrp1P56183 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Rrp1P56183 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
Rrp1P56183 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Rrp1P56183 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.84
Rrp1P56183 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
Rrp1P56183 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Rrp1P56183 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Rrp1P56183 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Rrp1P56183 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Rrp1P56183 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Rrp1P56183 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
Rrp1P56183 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Rrp1P56183 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Rrp1P56183 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Rrp1P56183 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Rrp1P56183 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Rrp1P56183 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Rrp1P56183 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Rrp1P56183 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Rrp1P56183 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
Rrp1P56183 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Rrp1P56183 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
Rrp1P56183 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Rrp1P56183 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
Rrp1P56183 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Rrp1P56183 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Rrp1P56183 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Rrp1P56183 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Rrp1P56183 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Rrp1P56183 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Rrp1P56183 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Rrp1P56183 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Rrp1P56183 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
Rrp1P56183 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Rrp1P56183 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
Rrp1P56183 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Rrp1P56183 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Rrp1P56183 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Rrp1P56183 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Rrp1P56183 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Rrp1P56183 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Rrp1P56183 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Rrp1P56183 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
Rrp1P56183 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
Rrp1P56183 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
Rrp1P56183 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Rrp1P56183 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Rrp1P56183 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Rrp1P56183 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
Rrp1P56183 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Rrp1P56183 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Rrp1P56183 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Rrp1P56183 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Rrp1P56183 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Rrp1P56183 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Rrp1P56183 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Rrp1P56183 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Rrp1P56183 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Rrp1P56183 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Rrp1P56183 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Rrp1P56183 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Rrp1P56183 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Rrp1P56183 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Rrp1P56183 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Rrp1P56183 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Rrp1P56183 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
Rrp1P56183 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Rrp1P56183 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Rrp1P56183 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
Rrp1P56183 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Rrp1P56183 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Rrp1P56183 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Rrp1P56183 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Rrp1P56183 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.2 ms