Protein–RNA interactions for Protein: P55284

Cdh5, Cadherin-5, mousemouse

Predictions only

Length 784 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdh5P55284 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cdh5P55284 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Cdh5P55284 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cdh5P55284 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cdh5P55284 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cdh5P55284 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cdh5P55284 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cdh5P55284 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cdh5P55284 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cdh5P55284 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cdh5P55284 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cdh5P55284 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cdh5P55284 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Cdh5P55284 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cdh5P55284 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cdh5P55284 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cdh5P55284 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cdh5P55284 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cdh5P55284 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Cdh5P55284 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cdh5P55284 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cdh5P55284 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cdh5P55284 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Cdh5P55284 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cdh5P55284 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cdh5P55284 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cdh5P55284 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cdh5P55284 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cdh5P55284 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cdh5P55284 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cdh5P55284 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cdh5P55284 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cdh5P55284 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cdh5P55284 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cdh5P55284 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cdh5P55284 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cdh5P55284 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cdh5P55284 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cdh5P55284 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cdh5P55284 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cdh5P55284 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cdh5P55284 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cdh5P55284 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cdh5P55284 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cdh5P55284 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cdh5P55284 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Cdh5P55284 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Cdh5P55284 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Cdh5P55284 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Cdh5P55284 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cdh5P55284 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cdh5P55284 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cdh5P55284 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Cdh5P55284 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Cdh5P55284 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cdh5P55284 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cdh5P55284 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cdh5P55284 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cdh5P55284 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cdh5P55284 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cdh5P55284 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cdh5P55284 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cdh5P55284 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cdh5P55284 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cdh5P55284 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cdh5P55284 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cdh5P55284 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cdh5P55284 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Cdh5P55284 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cdh5P55284 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cdh5P55284 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cdh5P55284 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cdh5P55284 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cdh5P55284 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cdh5P55284 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Cdh5P55284 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cdh5P55284 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cdh5P55284 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cdh5P55284 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cdh5P55284 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cdh5P55284 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cdh5P55284 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cdh5P55284 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cdh5P55284 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cdh5P55284 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Cdh5P55284 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cdh5P55284 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cdh5P55284 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cdh5P55284 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cdh5P55284 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cdh5P55284 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cdh5P55284 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cdh5P55284 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cdh5P55284 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cdh5P55284 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cdh5P55284 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cdh5P55284 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cdh5P55284 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cdh5P55284 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cdh5P55284 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.2 ms