Protein–RNA interactions for Protein: P53395

Dbt, Lipoamide acyltransferase component of branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase complex, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DbtP53395 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
DbtP53395 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
DbtP53395 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
DbtP53395 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
DbtP53395 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
DbtP53395 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
DbtP53395 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
DbtP53395 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
DbtP53395 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
DbtP53395 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
DbtP53395 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
DbtP53395 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
DbtP53395 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
DbtP53395 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
DbtP53395 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
DbtP53395 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
DbtP53395 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
DbtP53395 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
DbtP53395 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
DbtP53395 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
DbtP53395 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
DbtP53395 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
DbtP53395 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
DbtP53395 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
DbtP53395 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
DbtP53395 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
DbtP53395 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
DbtP53395 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
DbtP53395 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
DbtP53395 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
DbtP53395 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
DbtP53395 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
DbtP53395 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
DbtP53395 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
DbtP53395 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
DbtP53395 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
DbtP53395 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
DbtP53395 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
DbtP53395 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
DbtP53395 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
DbtP53395 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
DbtP53395 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DbtP53395 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
DbtP53395 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DbtP53395 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DbtP53395 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DbtP53395 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DbtP53395 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
DbtP53395 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
DbtP53395 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
DbtP53395 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
DbtP53395 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
DbtP53395 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DbtP53395 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DbtP53395 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DbtP53395 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DbtP53395 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DbtP53395 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DbtP53395 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DbtP53395 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
DbtP53395 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DbtP53395 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DbtP53395 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DbtP53395 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DbtP53395 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DbtP53395 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
DbtP53395 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DbtP53395 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
DbtP53395 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DbtP53395 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DbtP53395 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
DbtP53395 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DbtP53395 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
DbtP53395 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DbtP53395 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
DbtP53395 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
DbtP53395 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
DbtP53395 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
DbtP53395 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
DbtP53395 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
DbtP53395 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
DbtP53395 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
DbtP53395 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
DbtP53395 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DbtP53395 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DbtP53395 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
DbtP53395 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
DbtP53395 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
DbtP53395 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
DbtP53395 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
DbtP53395 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
DbtP53395 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
DbtP53395 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
DbtP53395 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
DbtP53395 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
DbtP53395 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
DbtP53395 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
DbtP53395 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
DbtP53395 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
DbtP53395 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms