Protein–RNA interactions for Protein: P52955

Lbx1, Transcription factor LBX1, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lbx1P52955 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Lbx1P52955 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Lbx1P52955 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Lbx1P52955 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Lbx1P52955 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Lbx1P52955 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Lbx1P52955 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Lbx1P52955 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Lbx1P52955 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Lbx1P52955 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Lbx1P52955 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Lbx1P52955 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Lbx1P52955 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Lbx1P52955 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Lbx1P52955 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Lbx1P52955 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Lbx1P52955 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Lbx1P52955 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Lbx1P52955 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Lbx1P52955 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Lbx1P52955 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Lbx1P52955 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Lbx1P52955 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Lbx1P52955 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Lbx1P52955 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Lbx1P52955 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Lbx1P52955 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Lbx1P52955 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Lbx1P52955 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Lbx1P52955 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Lbx1P52955 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Lbx1P52955 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Lbx1P52955 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Lbx1P52955 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Lbx1P52955 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Lbx1P52955 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Lbx1P52955 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Lbx1P52955 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Lbx1P52955 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Lbx1P52955 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Lbx1P52955 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Lbx1P52955 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Lbx1P52955 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Lbx1P52955 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Lbx1P52955 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Lbx1P52955 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Lbx1P52955 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Lbx1P52955 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Lbx1P52955 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Lbx1P52955 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Lbx1P52955 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Lbx1P52955 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Lbx1P52955 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Lbx1P52955 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Lbx1P52955 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Lbx1P52955 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Lbx1P52955 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Lbx1P52955 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Lbx1P52955 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Lbx1P52955 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Lbx1P52955 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Lbx1P52955 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Lbx1P52955 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Lbx1P52955 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Lbx1P52955 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Lbx1P52955 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Lbx1P52955 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Lbx1P52955 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Lbx1P52955 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Lbx1P52955 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Lbx1P52955 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Lbx1P52955 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Lbx1P52955 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Lbx1P52955 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Lbx1P52955 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Lbx1P52955 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Lbx1P52955 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Lbx1P52955 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Lbx1P52955 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Lbx1P52955 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Lbx1P52955 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Lbx1P52955 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Lbx1P52955 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Lbx1P52955 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Lbx1P52955 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Lbx1P52955 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Lbx1P52955 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Lbx1P52955 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Lbx1P52955 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Lbx1P52955 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Lbx1P52955 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Lbx1P52955 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Lbx1P52955 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Lbx1P52955 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Lbx1P52955 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Lbx1P52955 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Lbx1P52955 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Lbx1P52955 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Lbx1P52955 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Lbx1P52955 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.1 ms