Protein–RNA interactions for Protein: P51448

Rora, Nuclear receptor ROR-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 523 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RoraP51448 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
RoraP51448 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RoraP51448 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RoraP51448 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RoraP51448 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RoraP51448 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RoraP51448 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RoraP51448 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RoraP51448 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RoraP51448 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RoraP51448 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RoraP51448 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RoraP51448 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RoraP51448 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RoraP51448 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RoraP51448 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RoraP51448 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
RoraP51448 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RoraP51448 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RoraP51448 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RoraP51448 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RoraP51448 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RoraP51448 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RoraP51448 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RoraP51448 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
RoraP51448 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RoraP51448 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RoraP51448 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RoraP51448 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RoraP51448 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RoraP51448 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RoraP51448 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RoraP51448 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
RoraP51448 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RoraP51448 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RoraP51448 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RoraP51448 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RoraP51448 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RoraP51448 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RoraP51448 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RoraP51448 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RoraP51448 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RoraP51448 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RoraP51448 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RoraP51448 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RoraP51448 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
RoraP51448 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RoraP51448 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RoraP51448 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RoraP51448 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RoraP51448 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RoraP51448 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RoraP51448 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
RoraP51448 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RoraP51448 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RoraP51448 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RoraP51448 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RoraP51448 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RoraP51448 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RoraP51448 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RoraP51448 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RoraP51448 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RoraP51448 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RoraP51448 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RoraP51448 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RoraP51448 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RoraP51448 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RoraP51448 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RoraP51448 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RoraP51448 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RoraP51448 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RoraP51448 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RoraP51448 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
RoraP51448 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RoraP51448 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RoraP51448 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RoraP51448 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RoraP51448 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RoraP51448 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RoraP51448 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RoraP51448 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RoraP51448 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RoraP51448 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
RoraP51448 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RoraP51448 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RoraP51448 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RoraP51448 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RoraP51448 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RoraP51448 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RoraP51448 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RoraP51448 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RoraP51448 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RoraP51448 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RoraP51448 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RoraP51448 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RoraP51448 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RoraP51448 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RoraP51448 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RoraP51448 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RoraP51448 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms