Protein–RNA interactions for Protein: P50714

Defa16, Alpha-defensin 16, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa16P50714 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16,29■□□□□ 0,2
Defa16P50714 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC16,29■□□□□ 0,2
Defa16P50714 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16,29■□□□□ 0,2
Defa16P50714 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,29■□□□□ 0,2
Defa16P50714 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,29■□□□□ 0,2
Defa16P50714 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,28■□□□□ 0,2
Defa16P50714 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,28■□□□□ 0,2
Defa16P50714 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16,28■□□□□ 0,2
Defa16P50714 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC16,28■□□□□ 0,2
Defa16P50714 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC16,28■□□□□ 0,2
Defa16P50714 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16,27■□□□□ 0,2
Defa16P50714 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16,27■□□□□ 0,2
Defa16P50714 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16,27■□□□□ 0,2
Defa16P50714 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16,27■□□□□ 0,2
Defa16P50714 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16,27■□□□□ 0,2
Defa16P50714 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,27■□□□□ 0,19
Defa16P50714 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16,27■□□□□ 0,19
Defa16P50714 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16,27■□□□□ 0,19
Defa16P50714 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,27■□□□□ 0,19
Defa16P50714 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16,27■□□□□ 0,19
Defa16P50714 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16,27■□□□□ 0,19
Defa16P50714 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16,26■□□□□ 0,19
Defa16P50714 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16,26■□□□□ 0,19
Defa16P50714 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC16,26■□□□□ 0,19
Defa16P50714 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,26■□□□□ 0,19
Defa16P50714 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC16,26■□□□□ 0,19
Defa16P50714 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC16,26■□□□□ 0,19
Defa16P50714 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,25■□□□□ 0,19
Defa16P50714 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16,25■□□□□ 0,19
Defa16P50714 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC16,25■□□□□ 0,19
Defa16P50714 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC16,25■□□□□ 0,19
Defa16P50714 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC16,25■□□□□ 0,19
Defa16P50714 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,24■□□□□ 0,19
Defa16P50714 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,24■□□□□ 0,19
Defa16P50714 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC16,24■□□□□ 0,19
Defa16P50714 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16,23■□□□□ 0,19
Defa16P50714 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16,23■□□□□ 0,19
Defa16P50714 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,22■□□□□ 0,19
Defa16P50714 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC16,22■□□□□ 0,19
Defa16P50714 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16,22■□□□□ 0,19
Defa16P50714 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC16,22■□□□□ 0,19
Defa16P50714 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,22■□□□□ 0,19
Defa16P50714 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16,21■□□□□ 0,19
Defa16P50714 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC16,21■□□□□ 0,19
Defa16P50714 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC16,21■□□□□ 0,19
Defa16P50714 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC16,21■□□□□ 0,19
Defa16P50714 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,21■□□□□ 0,19
Defa16P50714 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,21■□□□□ 0,19
Defa16P50714 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC16,21■□□□□ 0,19
Defa16P50714 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16,21■□□□□ 0,18
Defa16P50714 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC16,2■□□□□ 0,18
Defa16P50714 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16,2■□□□□ 0,18
Defa16P50714 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,2■□□□□ 0,18
Defa16P50714 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,2■□□□□ 0,18
Defa16P50714 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16,19■□□□□ 0,18
Defa16P50714 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC16,19■□□□□ 0,18
Defa16P50714 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16,19■□□□□ 0,18
Defa16P50714 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16,19■□□□□ 0,18
Defa16P50714 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,18■□□□□ 0,18
Defa16P50714 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,18■□□□□ 0,18
Defa16P50714 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16,18■□□□□ 0,18
Defa16P50714 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16,18■□□□□ 0,18
Defa16P50714 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC16,18■□□□□ 0,18
Defa16P50714 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16,18■□□□□ 0,18
Defa16P50714 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,17■□□□□ 0,18
Defa16P50714 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,17■□□□□ 0,18
Defa16P50714 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16,17■□□□□ 0,18
Defa16P50714 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16,17■□□□□ 0,18
Defa16P50714 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC16,17■□□□□ 0,18
Defa16P50714 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC16,17■□□□□ 0,18
Defa16P50714 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC16,16■□□□□ 0,18
Defa16P50714 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,16■□□□□ 0,18
Defa16P50714 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16,16■□□□□ 0,18
Defa16P50714 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16,16■□□□□ 0,18
Defa16P50714 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16,16■□□□□ 0,18
Defa16P50714 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC16,16■□□□□ 0,18
Defa16P50714 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16,16■□□□□ 0,18
Defa16P50714 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,16■□□□□ 0,18
Defa16P50714 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,16■□□□□ 0,18
Defa16P50714 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,16■□□□□ 0,18
Defa16P50714 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16,16■□□□□ 0,18
Defa16P50714 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC16,16■□□□□ 0,18
Defa16P50714 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC16,15■□□□□ 0,18
Defa16P50714 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC16,15■□□□□ 0,18
Defa16P50714 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16,15■□□□□ 0,18
Defa16P50714 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,15■□□□□ 0,18
Defa16P50714 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16,14■□□□□ 0,17
Defa16P50714 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,14■□□□□ 0,17
Defa16P50714 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16,14■□□□□ 0,17
Defa16P50714 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,14■□□□□ 0,17
Defa16P50714 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16,14■□□□□ 0,17
Defa16P50714 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC16,14■□□□□ 0,17
Defa16P50714 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16,13■□□□□ 0,17
Defa16P50714 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC16,13■□□□□ 0,17
Defa16P50714 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC16,13■□□□□ 0,17
Defa16P50714 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC16,12■□□□□ 0,17
Defa16P50714 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,12■□□□□ 0,17
Defa16P50714 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,12■□□□□ 0,17
Defa16P50714 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,12■□□□□ 0,17
Defa16P50714 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,12■□□□□ 0,17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33,7 ms