Protein–RNA interactions for Protein: P50637

Tspo, Translocator protein, mousemouse

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TspoP50637 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
TspoP50637 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
TspoP50637 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
TspoP50637 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
TspoP50637 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
TspoP50637 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
TspoP50637 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
TspoP50637 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
TspoP50637 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
TspoP50637 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
TspoP50637 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
TspoP50637 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
TspoP50637 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
TspoP50637 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
TspoP50637 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
TspoP50637 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
TspoP50637 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
TspoP50637 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
TspoP50637 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
TspoP50637 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
TspoP50637 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
TspoP50637 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
TspoP50637 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
TspoP50637 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
TspoP50637 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
TspoP50637 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
TspoP50637 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
TspoP50637 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
TspoP50637 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
TspoP50637 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC19.65■□□□□ 0.74
TspoP50637 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
TspoP50637 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
TspoP50637 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
TspoP50637 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.74
TspoP50637 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
TspoP50637 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
TspoP50637 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
TspoP50637 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
TspoP50637 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
TspoP50637 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
TspoP50637 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
TspoP50637 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
TspoP50637 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TspoP50637 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
TspoP50637 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TspoP50637 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TspoP50637 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TspoP50637 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TspoP50637 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
TspoP50637 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
TspoP50637 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TspoP50637 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TspoP50637 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TspoP50637 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TspoP50637 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
TspoP50637 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TspoP50637 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TspoP50637 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TspoP50637 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TspoP50637 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TspoP50637 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TspoP50637 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TspoP50637 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TspoP50637 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
TspoP50637 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
TspoP50637 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TspoP50637 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TspoP50637 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TspoP50637 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TspoP50637 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TspoP50637 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TspoP50637 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TspoP50637 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TspoP50637 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TspoP50637 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TspoP50637 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TspoP50637 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TspoP50637 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TspoP50637 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TspoP50637 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TspoP50637 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TspoP50637 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TspoP50637 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TspoP50637 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TspoP50637 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TspoP50637 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TspoP50637 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TspoP50637 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TspoP50637 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TspoP50637 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
TspoP50637 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TspoP50637 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TspoP50637 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
TspoP50637 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TspoP50637 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
TspoP50637 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
TspoP50637 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
TspoP50637 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TspoP50637 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TspoP50637 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
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