Protein–RNA interactions for Protein: P50228

Cxcl5, C-X-C motif chemokine 5, mousemouse

Predictions only

Length 132 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcl5P50228 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Cxcl5P50228 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cxcl5P50228 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Cxcl5P50228 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cxcl5P50228 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cxcl5P50228 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cxcl5P50228 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cxcl5P50228 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cxcl5P50228 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cxcl5P50228 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cxcl5P50228 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cxcl5P50228 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cxcl5P50228 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cxcl5P50228 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cxcl5P50228 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cxcl5P50228 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cxcl5P50228 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cxcl5P50228 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cxcl5P50228 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cxcl5P50228 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cxcl5P50228 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cxcl5P50228 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cxcl5P50228 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cxcl5P50228 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cxcl5P50228 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cxcl5P50228 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cxcl5P50228 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cxcl5P50228 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cxcl5P50228 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cxcl5P50228 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cxcl5P50228 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cxcl5P50228 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cxcl5P50228 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cxcl5P50228 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cxcl5P50228 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cxcl5P50228 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cxcl5P50228 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cxcl5P50228 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cxcl5P50228 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Cxcl5P50228 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cxcl5P50228 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cxcl5P50228 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Cxcl5P50228 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cxcl5P50228 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cxcl5P50228 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cxcl5P50228 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cxcl5P50228 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cxcl5P50228 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Cxcl5P50228 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cxcl5P50228 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cxcl5P50228 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cxcl5P50228 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cxcl5P50228 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cxcl5P50228 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cxcl5P50228 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cxcl5P50228 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cxcl5P50228 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cxcl5P50228 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cxcl5P50228 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cxcl5P50228 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cxcl5P50228 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Cxcl5P50228 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cxcl5P50228 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cxcl5P50228 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cxcl5P50228 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cxcl5P50228 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cxcl5P50228 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cxcl5P50228 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cxcl5P50228 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cxcl5P50228 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cxcl5P50228 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cxcl5P50228 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cxcl5P50228 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cxcl5P50228 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cxcl5P50228 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cxcl5P50228 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cxcl5P50228 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cxcl5P50228 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cxcl5P50228 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cxcl5P50228 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cxcl5P50228 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Cxcl5P50228 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cxcl5P50228 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cxcl5P50228 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cxcl5P50228 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cxcl5P50228 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cxcl5P50228 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cxcl5P50228 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cxcl5P50228 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cxcl5P50228 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Cxcl5P50228 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Cxcl5P50228 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cxcl5P50228 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cxcl5P50228 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cxcl5P50228 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cxcl5P50228 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cxcl5P50228 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cxcl5P50228 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cxcl5P50228 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cxcl5P50228 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms