Protein–RNA interactions for Protein: P48377

Rfx1, MHC class II regulatory factor RFX1, mousemouse

Predictions only

Length 963 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfx1P48377 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Rfx1P48377 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Rfx1P48377 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Rfx1P48377 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Rfx1P48377 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Rfx1P48377 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Rfx1P48377 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Rfx1P48377 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Rfx1P48377 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Rfx1P48377 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Rfx1P48377 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
Rfx1P48377 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Rfx1P48377 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Rfx1P48377 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Rfx1P48377 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Rfx1P48377 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Rfx1P48377 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Rfx1P48377 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Rfx1P48377 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Rfx1P48377 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Rfx1P48377 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Rfx1P48377 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Rfx1P48377 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Rfx1P48377 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Rfx1P48377 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Rfx1P48377 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Rfx1P48377 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Rfx1P48377 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Rfx1P48377 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Rfx1P48377 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Rfx1P48377 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Rfx1P48377 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Rfx1P48377 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Rfx1P48377 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Rfx1P48377 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Rfx1P48377 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
Rfx1P48377 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Rfx1P48377 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Rfx1P48377 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Rfx1P48377 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Rfx1P48377 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Rfx1P48377 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Rfx1P48377 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Rfx1P48377 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Rfx1P48377 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Rfx1P48377 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Rfx1P48377 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Rfx1P48377 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Rfx1P48377 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Rfx1P48377 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Rfx1P48377 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
Rfx1P48377 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Rfx1P48377 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Rfx1P48377 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Rfx1P48377 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Rfx1P48377 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Rfx1P48377 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Rfx1P48377 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Rfx1P48377 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Rfx1P48377 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Rfx1P48377 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Rfx1P48377 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Rfx1P48377 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Rfx1P48377 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
Rfx1P48377 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Rfx1P48377 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Rfx1P48377 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Rfx1P48377 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Rfx1P48377 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Rfx1P48377 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Rfx1P48377 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Rfx1P48377 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Rfx1P48377 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Rfx1P48377 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Rfx1P48377 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Rfx1P48377 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Rfx1P48377 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Rfx1P48377 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Rfx1P48377 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Rfx1P48377 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Rfx1P48377 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Rfx1P48377 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Rfx1P48377 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Rfx1P48377 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Rfx1P48377 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Rfx1P48377 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Rfx1P48377 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Rfx1P48377 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Rfx1P48377 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
Rfx1P48377 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Rfx1P48377 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Rfx1P48377 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Rfx1P48377 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Rfx1P48377 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Rfx1P48377 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
Rfx1P48377 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Rfx1P48377 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Rfx1P48377 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Rfx1P48377 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Rfx1P48377 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.5 ms