Protein–RNA interactions for Protein: P43406

Itgav, Integrin alpha-V, mousemouse

Predictions only

Length 1,044 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ItgavP43406 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ItgavP43406 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ItgavP43406 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ItgavP43406 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ItgavP43406 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ItgavP43406 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ItgavP43406 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ItgavP43406 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ItgavP43406 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ItgavP43406 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ItgavP43406 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ItgavP43406 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ItgavP43406 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ItgavP43406 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ItgavP43406 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ItgavP43406 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ItgavP43406 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ItgavP43406 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ItgavP43406 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ItgavP43406 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ItgavP43406 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ItgavP43406 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ItgavP43406 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ItgavP43406 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ItgavP43406 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ItgavP43406 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ItgavP43406 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ItgavP43406 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ItgavP43406 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ItgavP43406 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
ItgavP43406 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ItgavP43406 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ItgavP43406 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ItgavP43406 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ItgavP43406 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ItgavP43406 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ItgavP43406 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ItgavP43406 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ItgavP43406 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ItgavP43406 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ItgavP43406 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ItgavP43406 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ItgavP43406 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ItgavP43406 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ItgavP43406 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ItgavP43406 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ItgavP43406 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ItgavP43406 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ItgavP43406 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ItgavP43406 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ItgavP43406 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ItgavP43406 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ItgavP43406 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ItgavP43406 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ItgavP43406 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ItgavP43406 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
ItgavP43406 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ItgavP43406 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ItgavP43406 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ItgavP43406 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ItgavP43406 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ItgavP43406 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ItgavP43406 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ItgavP43406 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ItgavP43406 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ItgavP43406 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
ItgavP43406 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ItgavP43406 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ItgavP43406 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ItgavP43406 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ItgavP43406 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ItgavP43406 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ItgavP43406 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ItgavP43406 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ItgavP43406 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ItgavP43406 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ItgavP43406 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ItgavP43406 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ItgavP43406 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ItgavP43406 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ItgavP43406 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ItgavP43406 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
ItgavP43406 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ItgavP43406 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ItgavP43406 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ItgavP43406 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ItgavP43406 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ItgavP43406 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ItgavP43406 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ItgavP43406 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ItgavP43406 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
ItgavP43406 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
ItgavP43406 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
ItgavP43406 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ItgavP43406 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ItgavP43406 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ItgavP43406 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ItgavP43406 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
ItgavP43406 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ItgavP43406 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms