Protein–RNA interactions for Protein: P38585

Ttl, Tubulin--tyrosine ligase, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TtlP38585 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TtlP38585 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TtlP38585 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TtlP38585 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TtlP38585 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TtlP38585 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TtlP38585 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TtlP38585 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TtlP38585 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TtlP38585 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TtlP38585 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TtlP38585 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TtlP38585 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TtlP38585 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TtlP38585 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TtlP38585 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TtlP38585 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TtlP38585 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TtlP38585 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TtlP38585 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TtlP38585 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TtlP38585 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TtlP38585 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TtlP38585 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TtlP38585 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TtlP38585 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TtlP38585 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TtlP38585 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
TtlP38585 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TtlP38585 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TtlP38585 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TtlP38585 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TtlP38585 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TtlP38585 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TtlP38585 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TtlP38585 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TtlP38585 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TtlP38585 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TtlP38585 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TtlP38585 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TtlP38585 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TtlP38585 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TtlP38585 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TtlP38585 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TtlP38585 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TtlP38585 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TtlP38585 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TtlP38585 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TtlP38585 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
TtlP38585 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TtlP38585 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TtlP38585 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TtlP38585 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TtlP38585 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TtlP38585 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TtlP38585 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TtlP38585 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TtlP38585 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TtlP38585 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TtlP38585 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TtlP38585 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
TtlP38585 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
TtlP38585 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TtlP38585 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TtlP38585 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TtlP38585 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TtlP38585 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TtlP38585 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TtlP38585 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TtlP38585 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TtlP38585 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TtlP38585 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TtlP38585 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TtlP38585 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TtlP38585 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TtlP38585 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TtlP38585 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TtlP38585 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TtlP38585 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TtlP38585 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TtlP38585 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TtlP38585 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TtlP38585 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TtlP38585 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TtlP38585 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TtlP38585 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TtlP38585 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TtlP38585 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TtlP38585 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TtlP38585 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
TtlP38585 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TtlP38585 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TtlP38585 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TtlP38585 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TtlP38585 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TtlP38585 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TtlP38585 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TtlP38585 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TtlP38585 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
TtlP38585 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms