Protein–RNA interactions for Protein: P37913

Lig1, DNA ligase 1, mousemouse

Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lig1P37913 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Lig1P37913 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Lig1P37913 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Lig1P37913 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Lig1P37913 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Lig1P37913 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Lig1P37913 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
Lig1P37913 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Lig1P37913 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Lig1P37913 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Lig1P37913 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Lig1P37913 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
Lig1P37913 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Lig1P37913 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Lig1P37913 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Lig1P37913 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Lig1P37913 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Lig1P37913 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Lig1P37913 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Lig1P37913 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Lig1P37913 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Lig1P37913 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Lig1P37913 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Lig1P37913 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Lig1P37913 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Lig1P37913 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Lig1P37913 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Lig1P37913 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
Lig1P37913 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Lig1P37913 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Lig1P37913 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Lig1P37913 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Lig1P37913 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Lig1P37913 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Lig1P37913 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Lig1P37913 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Lig1P37913 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Lig1P37913 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Lig1P37913 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Lig1P37913 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Lig1P37913 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Lig1P37913 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Lig1P37913 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Lig1P37913 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Lig1P37913 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Lig1P37913 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Lig1P37913 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Lig1P37913 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
Lig1P37913 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Lig1P37913 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Lig1P37913 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Lig1P37913 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
Lig1P37913 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Lig1P37913 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Lig1P37913 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
Lig1P37913 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Lig1P37913 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Lig1P37913 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Lig1P37913 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Lig1P37913 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Lig1P37913 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Lig1P37913 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Lig1P37913 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Lig1P37913 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Lig1P37913 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Lig1P37913 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Lig1P37913 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Lig1P37913 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
Lig1P37913 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Lig1P37913 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
Lig1P37913 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Lig1P37913 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
Lig1P37913 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Lig1P37913 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
Lig1P37913 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Lig1P37913 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Lig1P37913 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Lig1P37913 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Lig1P37913 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
Lig1P37913 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
Lig1P37913 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
Lig1P37913 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Lig1P37913 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Lig1P37913 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Lig1P37913 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Lig1P37913 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Lig1P37913 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Lig1P37913 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Lig1P37913 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Lig1P37913 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Lig1P37913 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Lig1P37913 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Lig1P37913 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Lig1P37913 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Lig1P37913 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
Lig1P37913 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Lig1P37913 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Lig1P37913 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
Lig1P37913 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Lig1P37913 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.8 ms