Protein–RNA interactions for Protein: P35689

Ercc5, DNA repair protein complementing XP-G cells homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc5P35689 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ercc5P35689 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ercc5P35689 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ercc5P35689 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ercc5P35689 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Ercc5P35689 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ercc5P35689 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ercc5P35689 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ercc5P35689 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ercc5P35689 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ercc5P35689 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ercc5P35689 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ercc5P35689 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ercc5P35689 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ercc5P35689 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
Ercc5P35689 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ercc5P35689 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ercc5P35689 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ercc5P35689 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ercc5P35689 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
Ercc5P35689 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ercc5P35689 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ercc5P35689 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ercc5P35689 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ercc5P35689 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ercc5P35689 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ercc5P35689 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ercc5P35689 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ercc5P35689 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ercc5P35689 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ercc5P35689 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ercc5P35689 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ercc5P35689 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ercc5P35689 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ercc5P35689 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ercc5P35689 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ercc5P35689 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ercc5P35689 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ercc5P35689 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ercc5P35689 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ercc5P35689 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ercc5P35689 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ercc5P35689 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ercc5P35689 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ercc5P35689 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ercc5P35689 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ercc5P35689 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ercc5P35689 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ercc5P35689 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ercc5P35689 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ercc5P35689 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ercc5P35689 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ercc5P35689 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ercc5P35689 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ercc5P35689 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ercc5P35689 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ercc5P35689 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ercc5P35689 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ercc5P35689 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ercc5P35689 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ercc5P35689 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Ercc5P35689 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ercc5P35689 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ercc5P35689 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ercc5P35689 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ercc5P35689 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Ercc5P35689 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ercc5P35689 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
Ercc5P35689 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ercc5P35689 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ercc5P35689 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ercc5P35689 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ercc5P35689 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ercc5P35689 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ercc5P35689 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ercc5P35689 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ercc5P35689 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ercc5P35689 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ercc5P35689 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ercc5P35689 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ercc5P35689 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ercc5P35689 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ercc5P35689 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ercc5P35689 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ercc5P35689 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ercc5P35689 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ercc5P35689 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ercc5P35689 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ercc5P35689 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ercc5P35689 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Ercc5P35689 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ercc5P35689 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ercc5P35689 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ercc5P35689 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ercc5P35689 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ercc5P35689 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ercc5P35689 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ercc5P35689 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ercc5P35689 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ercc5P35689 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms