Protein–RNA interactions for Protein: P34056

Tfap2a, Transcription factor AP-2-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 437 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tfap2aP34056 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tfap2aP34056 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tfap2aP34056 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tfap2aP34056 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tfap2aP34056 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tfap2aP34056 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tfap2aP34056 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Tfap2aP34056 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tfap2aP34056 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tfap2aP34056 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tfap2aP34056 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tfap2aP34056 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tfap2aP34056 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tfap2aP34056 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tfap2aP34056 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tfap2aP34056 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tfap2aP34056 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Tfap2aP34056 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tfap2aP34056 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Tfap2aP34056 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tfap2aP34056 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tfap2aP34056 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tfap2aP34056 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tfap2aP34056 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tfap2aP34056 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tfap2aP34056 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tfap2aP34056 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tfap2aP34056 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tfap2aP34056 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tfap2aP34056 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tfap2aP34056 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tfap2aP34056 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tfap2aP34056 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tfap2aP34056 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tfap2aP34056 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tfap2aP34056 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tfap2aP34056 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tfap2aP34056 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tfap2aP34056 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tfap2aP34056 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tfap2aP34056 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tfap2aP34056 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tfap2aP34056 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tfap2aP34056 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tfap2aP34056 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tfap2aP34056 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tfap2aP34056 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tfap2aP34056 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tfap2aP34056 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tfap2aP34056 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tfap2aP34056 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tfap2aP34056 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tfap2aP34056 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tfap2aP34056 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tfap2aP34056 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tfap2aP34056 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tfap2aP34056 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tfap2aP34056 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tfap2aP34056 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tfap2aP34056 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tfap2aP34056 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tfap2aP34056 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tfap2aP34056 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tfap2aP34056 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tfap2aP34056 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tfap2aP34056 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tfap2aP34056 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tfap2aP34056 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tfap2aP34056 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tfap2aP34056 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tfap2aP34056 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Tfap2aP34056 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tfap2aP34056 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tfap2aP34056 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tfap2aP34056 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tfap2aP34056 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tfap2aP34056 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tfap2aP34056 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tfap2aP34056 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tfap2aP34056 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tfap2aP34056 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Tfap2aP34056 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Tfap2aP34056 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Tfap2aP34056 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tfap2aP34056 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tfap2aP34056 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tfap2aP34056 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tfap2aP34056 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tfap2aP34056 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tfap2aP34056 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tfap2aP34056 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tfap2aP34056 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tfap2aP34056 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tfap2aP34056 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tfap2aP34056 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tfap2aP34056 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tfap2aP34056 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tfap2aP34056 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tfap2aP34056 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tfap2aP34056 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.1 ms