Protein–RNA interactions for Protein: P31001

Des, Desmin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DesP31001 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
DesP31001 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
DesP31001 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
DesP31001 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
DesP31001 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
DesP31001 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
DesP31001 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
DesP31001 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
DesP31001 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
DesP31001 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
DesP31001 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
DesP31001 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
DesP31001 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
DesP31001 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
DesP31001 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
DesP31001 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
DesP31001 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
DesP31001 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
DesP31001 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
DesP31001 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
DesP31001 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
DesP31001 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
DesP31001 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
DesP31001 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
DesP31001 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
DesP31001 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
DesP31001 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
DesP31001 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
DesP31001 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
DesP31001 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
DesP31001 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
DesP31001 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
DesP31001 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
DesP31001 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
DesP31001 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
DesP31001 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
DesP31001 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
DesP31001 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
DesP31001 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
DesP31001 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
DesP31001 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
DesP31001 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
DesP31001 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
DesP31001 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
DesP31001 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
DesP31001 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
DesP31001 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
DesP31001 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
DesP31001 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
DesP31001 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
DesP31001 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
DesP31001 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
DesP31001 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
DesP31001 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
DesP31001 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
DesP31001 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
DesP31001 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
DesP31001 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
DesP31001 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
DesP31001 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
DesP31001 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
DesP31001 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
DesP31001 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
DesP31001 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
DesP31001 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
DesP31001 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
DesP31001 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
DesP31001 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
DesP31001 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
DesP31001 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
DesP31001 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
DesP31001 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
DesP31001 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
DesP31001 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
DesP31001 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
DesP31001 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
DesP31001 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
DesP31001 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
DesP31001 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
DesP31001 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
DesP31001 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
DesP31001 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
DesP31001 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
DesP31001 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
DesP31001 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
DesP31001 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
DesP31001 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
DesP31001 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
DesP31001 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
DesP31001 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
DesP31001 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
DesP31001 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
DesP31001 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
DesP31001 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
DesP31001 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
DesP31001 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
DesP31001 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
DesP31001 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
DesP31001 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
DesP31001 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.4 ms