Protein–RNA interactions for Protein: P23591

Tsta3, GDP-L-fucose synthase, mousemouse

Predictions only

Length 321 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tsta3P23591 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Tsta3P23591 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Tsta3P23591 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Tsta3P23591 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Tsta3P23591 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Tsta3P23591 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Tsta3P23591 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Tsta3P23591 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Tsta3P23591 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Tsta3P23591 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Tsta3P23591 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Tsta3P23591 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Tsta3P23591 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Tsta3P23591 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Tsta3P23591 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Tsta3P23591 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Tsta3P23591 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Tsta3P23591 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Tsta3P23591 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Tsta3P23591 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Tsta3P23591 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Tsta3P23591 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Tsta3P23591 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Tsta3P23591 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Tsta3P23591 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Tsta3P23591 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Tsta3P23591 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Tsta3P23591 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Tsta3P23591 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Tsta3P23591 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Tsta3P23591 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Tsta3P23591 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Tsta3P23591 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Tsta3P23591 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Tsta3P23591 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Tsta3P23591 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Tsta3P23591 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Tsta3P23591 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Tsta3P23591 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Tsta3P23591 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Tsta3P23591 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Tsta3P23591 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Tsta3P23591 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Tsta3P23591 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Tsta3P23591 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Tsta3P23591 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Tsta3P23591 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Tsta3P23591 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Tsta3P23591 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Tsta3P23591 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Tsta3P23591 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Tsta3P23591 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Tsta3P23591 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Tsta3P23591 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Tsta3P23591 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Tsta3P23591 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Tsta3P23591 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Tsta3P23591 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Tsta3P23591 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Tsta3P23591 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Tsta3P23591 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Tsta3P23591 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Tsta3P23591 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Tsta3P23591 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Tsta3P23591 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Tsta3P23591 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Tsta3P23591 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Tsta3P23591 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Tsta3P23591 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Tsta3P23591 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Tsta3P23591 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Tsta3P23591 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Tsta3P23591 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Tsta3P23591 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Tsta3P23591 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Tsta3P23591 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Tsta3P23591 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Tsta3P23591 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tsta3P23591 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tsta3P23591 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tsta3P23591 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Tsta3P23591 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Tsta3P23591 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tsta3P23591 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tsta3P23591 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tsta3P23591 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tsta3P23591 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tsta3P23591 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tsta3P23591 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tsta3P23591 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tsta3P23591 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Tsta3P23591 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Tsta3P23591 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Tsta3P23591 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Tsta3P23591 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Tsta3P23591 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Tsta3P23591 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Tsta3P23591 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Tsta3P23591 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tsta3P23591 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms