Protein–RNA interactions for Protein: P23242

Gja1, Gap junction alpha-1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gja1P23242 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Gja1P23242 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Gja1P23242 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Gja1P23242 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Gja1P23242 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Gja1P23242 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Gja1P23242 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Gja1P23242 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Gja1P23242 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Gja1P23242 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Gja1P23242 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Gja1P23242 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Gja1P23242 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Gja1P23242 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Gja1P23242 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Gja1P23242 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Gja1P23242 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Gja1P23242 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Gja1P23242 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Gja1P23242 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Gja1P23242 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Gja1P23242 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Gja1P23242 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Gja1P23242 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Gja1P23242 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Gja1P23242 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Gja1P23242 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Gja1P23242 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Gja1P23242 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Gja1P23242 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Gja1P23242 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Gja1P23242 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Gja1P23242 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Gja1P23242 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Gja1P23242 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Gja1P23242 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Gja1P23242 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Gja1P23242 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Gja1P23242 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Gja1P23242 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Gja1P23242 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Gja1P23242 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Gja1P23242 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Gja1P23242 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Gja1P23242 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Gja1P23242 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Gja1P23242 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Gja1P23242 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Gja1P23242 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Gja1P23242 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Gja1P23242 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Gja1P23242 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Gja1P23242 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Gja1P23242 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Gja1P23242 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Gja1P23242 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Gja1P23242 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Gja1P23242 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Gja1P23242 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Gja1P23242 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Gja1P23242 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Gja1P23242 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Gja1P23242 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Gja1P23242 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Gja1P23242 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Gja1P23242 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Gja1P23242 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Gja1P23242 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Gja1P23242 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Gja1P23242 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Gja1P23242 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Gja1P23242 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Gja1P23242 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Gja1P23242 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Gja1P23242 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Gja1P23242 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Gja1P23242 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Gja1P23242 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Gja1P23242 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Gja1P23242 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
Gja1P23242 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Gja1P23242 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Gja1P23242 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Gja1P23242 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Gja1P23242 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Gja1P23242 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Gja1P23242 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Gja1P23242 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Gja1P23242 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Gja1P23242 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Gja1P23242 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Gja1P23242 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Gja1P23242 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Gja1P23242 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Gja1P23242 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Gja1P23242 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Gja1P23242 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Gja1P23242 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Gja1P23242 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Gja1P23242 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms