Protein–RNA interactions for Protein: P21126

Ubl4a, Ubiquitin-like protein 4A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 157 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubl4aP21126 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ubl4aP21126 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ubl4aP21126 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ubl4aP21126 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ubl4aP21126 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ubl4aP21126 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ubl4aP21126 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ubl4aP21126 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ubl4aP21126 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ubl4aP21126 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ubl4aP21126 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ubl4aP21126 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ubl4aP21126 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ubl4aP21126 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ubl4aP21126 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ubl4aP21126 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ubl4aP21126 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ubl4aP21126 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ubl4aP21126 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ubl4aP21126 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ubl4aP21126 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ubl4aP21126 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ubl4aP21126 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ubl4aP21126 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ubl4aP21126 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ubl4aP21126 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ubl4aP21126 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ubl4aP21126 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ubl4aP21126 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ubl4aP21126 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ubl4aP21126 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ubl4aP21126 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ubl4aP21126 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ubl4aP21126 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ubl4aP21126 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ubl4aP21126 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Ubl4aP21126 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Ubl4aP21126 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Ubl4aP21126 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Ubl4aP21126 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ubl4aP21126 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ubl4aP21126 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ubl4aP21126 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ubl4aP21126 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ubl4aP21126 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ubl4aP21126 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ubl4aP21126 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ubl4aP21126 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ubl4aP21126 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ubl4aP21126 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ubl4aP21126 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ubl4aP21126 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ubl4aP21126 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ubl4aP21126 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ubl4aP21126 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ubl4aP21126 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ubl4aP21126 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ubl4aP21126 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ubl4aP21126 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ubl4aP21126 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ubl4aP21126 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ubl4aP21126 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ubl4aP21126 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ubl4aP21126 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
Ubl4aP21126 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Ubl4aP21126 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ubl4aP21126 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ubl4aP21126 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ubl4aP21126 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ubl4aP21126 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ubl4aP21126 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ubl4aP21126 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ubl4aP21126 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ubl4aP21126 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ubl4aP21126 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ubl4aP21126 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ubl4aP21126 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ubl4aP21126 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ubl4aP21126 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Ubl4aP21126 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ubl4aP21126 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ubl4aP21126 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ubl4aP21126 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ubl4aP21126 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ubl4aP21126 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ubl4aP21126 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ubl4aP21126 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ubl4aP21126 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ubl4aP21126 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ubl4aP21126 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ubl4aP21126 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ubl4aP21126 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ubl4aP21126 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Ubl4aP21126 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Ubl4aP21126 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ubl4aP21126 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ubl4aP21126 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ubl4aP21126 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ubl4aP21126 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ubl4aP21126 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.7 ms