Protein–RNA interactions for Protein: P19228

Csn1s1, Alpha-S1-casein, mousemouse

Predictions only

Length 313 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csn1s1P19228 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,07■□□□□ 0,96
Csn1s1P19228 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,07■□□□□ 0,96
Csn1s1P19228 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,07■□□□□ 0,96
Csn1s1P19228 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,07■□□□□ 0,96
Csn1s1P19228 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,07■□□□□ 0,96
Csn1s1P19228 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC21,07■□□□□ 0,96
Csn1s1P19228 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,07■□□□□ 0,96
Csn1s1P19228 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,06■□□□□ 0,96
Csn1s1P19228 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21,06■□□□□ 0,96
Csn1s1P19228 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,06■□□□□ 0,96
Csn1s1P19228 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC21,06■□□□□ 0,96
Csn1s1P19228 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC21,06■□□□□ 0,96
Csn1s1P19228 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,05■□□□□ 0,96
Csn1s1P19228 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21,05■□□□□ 0,96
Csn1s1P19228 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC21,04■□□□□ 0,96
Csn1s1P19228 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,04■□□□□ 0,96
Csn1s1P19228 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,04■□□□□ 0,96
Csn1s1P19228 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21,04■□□□□ 0,96
Csn1s1P19228 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21,04■□□□□ 0,96
Csn1s1P19228 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21,04■□□□□ 0,96
Csn1s1P19228 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC21,03■□□□□ 0,96
Csn1s1P19228 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC21,03■□□□□ 0,96
Csn1s1P19228 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21,03■□□□□ 0,96
Csn1s1P19228 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,02■□□□□ 0,96
Csn1s1P19228 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21,02■□□□□ 0,96
Csn1s1P19228 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC21,02■□□□□ 0,96
Csn1s1P19228 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,02■□□□□ 0,96
Csn1s1P19228 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC21,01■□□□□ 0,95
Csn1s1P19228 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,01■□□□□ 0,95
Csn1s1P19228 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,01■□□□□ 0,95
Csn1s1P19228 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,01■□□□□ 0,95
Csn1s1P19228 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,01■□□□□ 0,95
Csn1s1P19228 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0,95
Csn1s1P19228 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0,95
Csn1s1P19228 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20,98■□□□□ 0,95
Csn1s1P19228 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC20,98■□□□□ 0,95
Csn1s1P19228 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC20,98■□□□□ 0,95
Csn1s1P19228 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,98■□□□□ 0,95
Csn1s1P19228 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,97■□□□□ 0,95
Csn1s1P19228 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20,97■□□□□ 0,95
Csn1s1P19228 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,97■□□□□ 0,95
Csn1s1P19228 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20,97■□□□□ 0,95
Csn1s1P19228 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20,97■□□□□ 0,95
Csn1s1P19228 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,96■□□□□ 0,95
Csn1s1P19228 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20,96■□□□□ 0,95
Csn1s1P19228 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20,96■□□□□ 0,95
Csn1s1P19228 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,95■□□□□ 0,94
Csn1s1P19228 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20,95■□□□□ 0,94
Csn1s1P19228 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,95■□□□□ 0,94
Csn1s1P19228 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,95■□□□□ 0,94
Csn1s1P19228 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20,94■□□□□ 0,94
Csn1s1P19228 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,94■□□□□ 0,94
Csn1s1P19228 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20,93■□□□□ 0,94
Csn1s1P19228 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20,92■□□□□ 0,94
Csn1s1P19228 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,92■□□□□ 0,94
Csn1s1P19228 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,92■□□□□ 0,94
Csn1s1P19228 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,92■□□□□ 0,94
Csn1s1P19228 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20,92■□□□□ 0,94
Csn1s1P19228 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC20,91■□□□□ 0,94
Csn1s1P19228 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC20,91■□□□□ 0,94
Csn1s1P19228 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20,9■□□□□ 0,94
Csn1s1P19228 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC20,9■□□□□ 0,94
Csn1s1P19228 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,9■□□□□ 0,94
Csn1s1P19228 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20,9■□□□□ 0,94
Csn1s1P19228 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC20,9■□□□□ 0,94
Csn1s1P19228 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC20,89■□□□□ 0,94
Csn1s1P19228 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,89■□□□□ 0,94
Csn1s1P19228 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,89■□□□□ 0,94
Csn1s1P19228 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20,89■□□□□ 0,94
Csn1s1P19228 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20,89■□□□□ 0,93
Csn1s1P19228 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,89■□□□□ 0,93
Csn1s1P19228 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC20,89■□□□□ 0,93
Csn1s1P19228 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC20,89■□□□□ 0,93
Csn1s1P19228 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,88■□□□□ 0,93
Csn1s1P19228 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC20,88■□□□□ 0,93
Csn1s1P19228 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20,86■□□□□ 0,93
Csn1s1P19228 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20,86■□□□□ 0,93
Csn1s1P19228 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20,86■□□□□ 0,93
Csn1s1P19228 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC20,86■□□□□ 0,93
Csn1s1P19228 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20,86■□□□□ 0,93
Csn1s1P19228 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,86■□□□□ 0,93
Csn1s1P19228 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20,86■□□□□ 0,93
Csn1s1P19228 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20,85■□□□□ 0,93
Csn1s1P19228 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,85■□□□□ 0,93
Csn1s1P19228 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,85■□□□□ 0,93
Csn1s1P19228 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20,85■□□□□ 0,93
Csn1s1P19228 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,85■□□□□ 0,93
Csn1s1P19228 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20,85■□□□□ 0,93
Csn1s1P19228 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20,85■□□□□ 0,93
Csn1s1P19228 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20,85■□□□□ 0,93
Csn1s1P19228 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,84■□□□□ 0,93
Csn1s1P19228 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC20,84■□□□□ 0,93
Csn1s1P19228 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC20,84■□□□□ 0,93
Csn1s1P19228 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20,84■□□□□ 0,93
Csn1s1P19228 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC20,84■□□□□ 0,93
Csn1s1P19228 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20,83■□□□□ 0,93
Csn1s1P19228 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC20,83■□□□□ 0,93
Csn1s1P19228 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,83■□□□□ 0,93
Csn1s1P19228 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,83■□□□□ 0,92
Csn1s1P19228 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20,83■□□□□ 0,92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33,4 ms