Protein–RNA interactions for Protein: P18533

Ig heavy chain V region 733, mousemouse

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Length 117 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18533 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
P18533 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
P18533 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
P18533 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
P18533 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
P18533 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
P18533 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
P18533 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
P18533 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
P18533 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
P18533 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
P18533 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
P18533 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
P18533 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
P18533 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
P18533 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
P18533 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
P18533 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
P18533 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
P18533 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
P18533 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
P18533 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
P18533 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
P18533 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
P18533 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
P18533 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
P18533 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
P18533 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
P18533 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
P18533 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
P18533 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
P18533 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
P18533 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
P18533 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
P18533 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
P18533 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
P18533 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
P18533 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
P18533 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
P18533 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
P18533 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
P18533 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
P18533 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
P18533 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
P18533 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
P18533 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
P18533 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
P18533 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
P18533 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
P18533 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
P18533 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
P18533 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
P18533 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
P18533 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
P18533 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
P18533 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
P18533 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
P18533 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
P18533 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
P18533 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
P18533 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
P18533 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
P18533 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
P18533 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
P18533 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
P18533 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
P18533 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
P18533 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
P18533 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
P18533 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
P18533 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
P18533 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
P18533 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
P18533 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
P18533 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
P18533 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
P18533 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
P18533 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
P18533 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
P18533 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
P18533 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
P18533 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
P18533 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
P18533 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
P18533 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
P18533 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
P18533 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
P18533 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
P18533 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
P18533 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
P18533 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
P18533 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
P18533 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
P18533 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
P18533 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
P18533 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
P18533 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
P18533 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
P18533 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
P18533 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms