Protein–RNA interactions for Protein: P17534

Defa-rs2, Alpha-defensin-related sequence 2, mousemouse

Predictions only

Length 91 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa-rs2P17534 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Defa-rs2P17534 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Defa-rs2P17534 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Defa-rs2P17534 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Defa-rs2P17534 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Defa-rs2P17534 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Defa-rs2P17534 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Defa-rs2P17534 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Defa-rs2P17534 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Defa-rs2P17534 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Defa-rs2P17534 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Defa-rs2P17534 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Defa-rs2P17534 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Defa-rs2P17534 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Defa-rs2P17534 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Defa-rs2P17534 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Defa-rs2P17534 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Defa-rs2P17534 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Defa-rs2P17534 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Defa-rs2P17534 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Defa-rs2P17534 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Defa-rs2P17534 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Defa-rs2P17534 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Defa-rs2P17534 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Defa-rs2P17534 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Defa-rs2P17534 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Defa-rs2P17534 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Defa-rs2P17534 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Defa-rs2P17534 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Defa-rs2P17534 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Defa-rs2P17534 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Defa-rs2P17534 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Defa-rs2P17534 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Defa-rs2P17534 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Defa-rs2P17534 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Defa-rs2P17534 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Defa-rs2P17534 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Defa-rs2P17534 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Defa-rs2P17534 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Defa-rs2P17534 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Defa-rs2P17534 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Defa-rs2P17534 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Defa-rs2P17534 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Defa-rs2P17534 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Defa-rs2P17534 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Defa-rs2P17534 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Defa-rs2P17534 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Defa-rs2P17534 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Defa-rs2P17534 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Defa-rs2P17534 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Defa-rs2P17534 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Defa-rs2P17534 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Defa-rs2P17534 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Defa-rs2P17534 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Defa-rs2P17534 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Defa-rs2P17534 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Defa-rs2P17534 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Defa-rs2P17534 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Defa-rs2P17534 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Defa-rs2P17534 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Defa-rs2P17534 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Defa-rs2P17534 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Defa-rs2P17534 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Defa-rs2P17534 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Defa-rs2P17534 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Defa-rs2P17534 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Defa-rs2P17534 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Defa-rs2P17534 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Defa-rs2P17534 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Defa-rs2P17534 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Defa-rs2P17534 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Defa-rs2P17534 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Defa-rs2P17534 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Defa-rs2P17534 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Defa-rs2P17534 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Defa-rs2P17534 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Defa-rs2P17534 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Defa-rs2P17534 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Defa-rs2P17534 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Defa-rs2P17534 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Defa-rs2P17534 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Defa-rs2P17534 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Defa-rs2P17534 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Defa-rs2P17534 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Defa-rs2P17534 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Defa-rs2P17534 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Defa-rs2P17534 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Defa-rs2P17534 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Defa-rs2P17534 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Defa-rs2P17534 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Defa-rs2P17534 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Defa-rs2P17534 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Defa-rs2P17534 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Defa-rs2P17534 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Defa-rs2P17534 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Defa-rs2P17534 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Defa-rs2P17534 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Defa-rs2P17534 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Defa-rs2P17534 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Defa-rs2P17534 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.9 ms