Protein–RNA interactions for Protein: P15533

Trim30a, Tripartite motif-containing protein 30A, mousemouse

Predictions only

Length 496 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim30aP15533 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Trim30aP15533 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Trim30aP15533 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Trim30aP15533 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Trim30aP15533 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Trim30aP15533 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Trim30aP15533 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Trim30aP15533 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Trim30aP15533 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Trim30aP15533 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Trim30aP15533 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Trim30aP15533 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Trim30aP15533 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Trim30aP15533 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Trim30aP15533 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Trim30aP15533 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Trim30aP15533 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Trim30aP15533 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Trim30aP15533 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Trim30aP15533 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Trim30aP15533 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Trim30aP15533 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Trim30aP15533 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Trim30aP15533 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Trim30aP15533 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Trim30aP15533 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Trim30aP15533 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Trim30aP15533 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Trim30aP15533 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Trim30aP15533 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Trim30aP15533 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Trim30aP15533 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Trim30aP15533 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Trim30aP15533 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Trim30aP15533 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.72
Trim30aP15533 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Trim30aP15533 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Trim30aP15533 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Trim30aP15533 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Trim30aP15533 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Trim30aP15533 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Trim30aP15533 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Trim30aP15533 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Trim30aP15533 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Trim30aP15533 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Trim30aP15533 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Trim30aP15533 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Trim30aP15533 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Trim30aP15533 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
Trim30aP15533 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Trim30aP15533 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Trim30aP15533 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Trim30aP15533 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Trim30aP15533 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Trim30aP15533 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Trim30aP15533 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Trim30aP15533 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Trim30aP15533 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Trim30aP15533 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Trim30aP15533 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Trim30aP15533 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Trim30aP15533 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Trim30aP15533 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Trim30aP15533 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Trim30aP15533 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Trim30aP15533 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Trim30aP15533 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Trim30aP15533 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Trim30aP15533 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Trim30aP15533 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Trim30aP15533 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Trim30aP15533 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Trim30aP15533 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Trim30aP15533 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Trim30aP15533 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Trim30aP15533 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Trim30aP15533 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Trim30aP15533 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Trim30aP15533 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Trim30aP15533 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
Trim30aP15533 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC25.64■■□□□ 1.69
Trim30aP15533 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Trim30aP15533 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Trim30aP15533 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Trim30aP15533 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Trim30aP15533 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Trim30aP15533 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Trim30aP15533 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Trim30aP15533 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Trim30aP15533 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Trim30aP15533 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Trim30aP15533 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Trim30aP15533 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Trim30aP15533 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Trim30aP15533 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Trim30aP15533 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Trim30aP15533 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Trim30aP15533 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Trim30aP15533 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Trim30aP15533 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms