Protein–RNA interactions for Protein: P15209

Ntrk2, BDNF/NT-3 growth factors receptor, mousemouse

Predictions only

Length 821 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ntrk2P15209 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ntrk2P15209 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ntrk2P15209 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ntrk2P15209 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ntrk2P15209 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ntrk2P15209 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ntrk2P15209 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ntrk2P15209 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ntrk2P15209 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ntrk2P15209 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Ntrk2P15209 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ntrk2P15209 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ntrk2P15209 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ntrk2P15209 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ntrk2P15209 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ntrk2P15209 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ntrk2P15209 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ntrk2P15209 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ntrk2P15209 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ntrk2P15209 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ntrk2P15209 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ntrk2P15209 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ntrk2P15209 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ntrk2P15209 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ntrk2P15209 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ntrk2P15209 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ntrk2P15209 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ntrk2P15209 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ntrk2P15209 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ntrk2P15209 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Ntrk2P15209 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ntrk2P15209 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ntrk2P15209 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ntrk2P15209 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ntrk2P15209 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ntrk2P15209 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ntrk2P15209 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ntrk2P15209 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ntrk2P15209 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Ntrk2P15209 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Ntrk2P15209 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ntrk2P15209 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ntrk2P15209 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ntrk2P15209 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ntrk2P15209 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ntrk2P15209 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ntrk2P15209 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ntrk2P15209 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ntrk2P15209 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ntrk2P15209 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ntrk2P15209 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ntrk2P15209 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ntrk2P15209 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ntrk2P15209 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ntrk2P15209 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ntrk2P15209 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Ntrk2P15209 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ntrk2P15209 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ntrk2P15209 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ntrk2P15209 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ntrk2P15209 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ntrk2P15209 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ntrk2P15209 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Ntrk2P15209 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ntrk2P15209 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ntrk2P15209 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ntrk2P15209 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ntrk2P15209 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ntrk2P15209 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ntrk2P15209 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ntrk2P15209 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ntrk2P15209 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ntrk2P15209 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Ntrk2P15209 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ntrk2P15209 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ntrk2P15209 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ntrk2P15209 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Ntrk2P15209 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ntrk2P15209 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ntrk2P15209 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ntrk2P15209 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ntrk2P15209 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ntrk2P15209 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ntrk2P15209 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Ntrk2P15209 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ntrk2P15209 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ntrk2P15209 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ntrk2P15209 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ntrk2P15209 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ntrk2P15209 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ntrk2P15209 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ntrk2P15209 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ntrk2P15209 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ntrk2P15209 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Ntrk2P15209 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ntrk2P15209 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Ntrk2P15209 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ntrk2P15209 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ntrk2P15209 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ntrk2P15209 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 91.3 ms