Protein–RNA interactions for Protein: P14431

H2-Q9, H-2 class I histocompatibility antigen, Q9 alpha chain (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 200 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Q9P14431 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
H2-Q9P14431 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
H2-Q9P14431 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
H2-Q9P14431 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
H2-Q9P14431 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
H2-Q9P14431 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
H2-Q9P14431 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
H2-Q9P14431 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
H2-Q9P14431 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
H2-Q9P14431 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
H2-Q9P14431 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
H2-Q9P14431 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
H2-Q9P14431 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.27
H2-Q9P14431 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
H2-Q9P14431 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
H2-Q9P14431 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
H2-Q9P14431 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
H2-Q9P14431 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC23■■□□□ 1.27
H2-Q9P14431 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
H2-Q9P14431 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
H2-Q9P14431 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
H2-Q9P14431 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
H2-Q9P14431 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
H2-Q9P14431 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
H2-Q9P14431 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
H2-Q9P14431 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
H2-Q9P14431 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
H2-Q9P14431 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
H2-Q9P14431 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
H2-Q9P14431 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
H2-Q9P14431 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
H2-Q9P14431 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
H2-Q9P14431 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
H2-Q9P14431 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
H2-Q9P14431 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
H2-Q9P14431 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
H2-Q9P14431 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
H2-Q9P14431 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
H2-Q9P14431 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
H2-Q9P14431 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
H2-Q9P14431 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
H2-Q9P14431 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
H2-Q9P14431 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
H2-Q9P14431 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
H2-Q9P14431 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
H2-Q9P14431 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
H2-Q9P14431 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
H2-Q9P14431 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
H2-Q9P14431 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
H2-Q9P14431 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
H2-Q9P14431 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
H2-Q9P14431 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
H2-Q9P14431 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
H2-Q9P14431 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
H2-Q9P14431 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
H2-Q9P14431 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
H2-Q9P14431 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
H2-Q9P14431 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
H2-Q9P14431 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
H2-Q9P14431 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
H2-Q9P14431 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
H2-Q9P14431 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
H2-Q9P14431 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
H2-Q9P14431 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
H2-Q9P14431 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
H2-Q9P14431 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
H2-Q9P14431 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
H2-Q9P14431 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
H2-Q9P14431 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
H2-Q9P14431 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
H2-Q9P14431 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
H2-Q9P14431 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
H2-Q9P14431 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
H2-Q9P14431 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
H2-Q9P14431 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
H2-Q9P14431 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
H2-Q9P14431 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
H2-Q9P14431 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
H2-Q9P14431 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
H2-Q9P14431 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
H2-Q9P14431 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
H2-Q9P14431 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
H2-Q9P14431 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
H2-Q9P14431 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
H2-Q9P14431 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
H2-Q9P14431 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
H2-Q9P14431 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
H2-Q9P14431 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
H2-Q9P14431 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
H2-Q9P14431 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
H2-Q9P14431 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
H2-Q9P14431 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
H2-Q9P14431 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
H2-Q9P14431 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
H2-Q9P14431 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
H2-Q9P14431 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
H2-Q9P14431 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
H2-Q9P14431 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
H2-Q9P14431 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
H2-Q9P14431 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.1 ms