Protein–RNA interactions for Protein: P14427

H2-D1, H-2 class I histocompatibility antigen, D-P alpha chain, mousemouse

Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-D1P14427 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
H2-D1P14427 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
H2-D1P14427 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
H2-D1P14427 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
H2-D1P14427 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
H2-D1P14427 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
H2-D1P14427 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
H2-D1P14427 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
H2-D1P14427 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
H2-D1P14427 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
H2-D1P14427 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
H2-D1P14427 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
H2-D1P14427 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
H2-D1P14427 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
H2-D1P14427 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
H2-D1P14427 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
H2-D1P14427 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
H2-D1P14427 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
H2-D1P14427 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
H2-D1P14427 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
H2-D1P14427 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
H2-D1P14427 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
H2-D1P14427 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
H2-D1P14427 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
H2-D1P14427 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
H2-D1P14427 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
H2-D1P14427 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
H2-D1P14427 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
H2-D1P14427 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
H2-D1P14427 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
H2-D1P14427 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
H2-D1P14427 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
H2-D1P14427 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
H2-D1P14427 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
H2-D1P14427 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
H2-D1P14427 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
H2-D1P14427 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
H2-D1P14427 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
H2-D1P14427 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
H2-D1P14427 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
H2-D1P14427 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
H2-D1P14427 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
H2-D1P14427 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
H2-D1P14427 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
H2-D1P14427 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
H2-D1P14427 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
H2-D1P14427 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
H2-D1P14427 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
H2-D1P14427 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
H2-D1P14427 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
H2-D1P14427 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
H2-D1P14427 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
H2-D1P14427 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
H2-D1P14427 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
H2-D1P14427 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
H2-D1P14427 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
H2-D1P14427 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
H2-D1P14427 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
H2-D1P14427 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
H2-D1P14427 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
H2-D1P14427 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
H2-D1P14427 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
H2-D1P14427 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
H2-D1P14427 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
H2-D1P14427 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
H2-D1P14427 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
H2-D1P14427 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
H2-D1P14427 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
H2-D1P14427 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
H2-D1P14427 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
H2-D1P14427 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
H2-D1P14427 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
H2-D1P14427 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
H2-D1P14427 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
H2-D1P14427 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
H2-D1P14427 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
H2-D1P14427 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
H2-D1P14427 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
H2-D1P14427 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
H2-D1P14427 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
H2-D1P14427 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
H2-D1P14427 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
H2-D1P14427 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
H2-D1P14427 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
H2-D1P14427 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
H2-D1P14427 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
H2-D1P14427 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
H2-D1P14427 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
H2-D1P14427 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
H2-D1P14427 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
H2-D1P14427 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
H2-D1P14427 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
H2-D1P14427 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
H2-D1P14427 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
H2-D1P14427 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
H2-D1P14427 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
H2-D1P14427 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
H2-D1P14427 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
H2-D1P14427 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
H2-D1P14427 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms