Protein–RNA interactions for Protein: P13504

Il1r1, Interleukin-1 receptor type 1, mousemouse

Predictions only

Length 576 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Il1r1P13504 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Il1r1P13504 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Il1r1P13504 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Il1r1P13504 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Il1r1P13504 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Il1r1P13504 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Il1r1P13504 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Il1r1P13504 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Il1r1P13504 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Il1r1P13504 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Il1r1P13504 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Il1r1P13504 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Il1r1P13504 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Il1r1P13504 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Il1r1P13504 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Il1r1P13504 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Il1r1P13504 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Il1r1P13504 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Il1r1P13504 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Il1r1P13504 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Il1r1P13504 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Il1r1P13504 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Il1r1P13504 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Il1r1P13504 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Il1r1P13504 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Il1r1P13504 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Il1r1P13504 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Il1r1P13504 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Il1r1P13504 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Il1r1P13504 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.32■■□□□ 1
Il1r1P13504 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Il1r1P13504 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Il1r1P13504 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Il1r1P13504 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Il1r1P13504 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Il1r1P13504 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Il1r1P13504 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Il1r1P13504 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Il1r1P13504 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Il1r1P13504 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Il1r1P13504 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Il1r1P13504 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Il1r1P13504 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Il1r1P13504 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Il1r1P13504 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Il1r1P13504 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Il1r1P13504 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Il1r1P13504 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Il1r1P13504 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Il1r1P13504 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Il1r1P13504 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Il1r1P13504 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Il1r1P13504 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Il1r1P13504 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Il1r1P13504 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Il1r1P13504 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Il1r1P13504 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Il1r1P13504 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Il1r1P13504 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Il1r1P13504 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Il1r1P13504 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Il1r1P13504 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Il1r1P13504 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Il1r1P13504 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Il1r1P13504 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Il1r1P13504 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Il1r1P13504 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Il1r1P13504 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Il1r1P13504 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Il1r1P13504 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Il1r1P13504 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Il1r1P13504 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Il1r1P13504 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Il1r1P13504 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Il1r1P13504 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Il1r1P13504 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Il1r1P13504 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Il1r1P13504 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Il1r1P13504 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Il1r1P13504 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Il1r1P13504 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Il1r1P13504 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Il1r1P13504 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Il1r1P13504 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Il1r1P13504 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Il1r1P13504 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Il1r1P13504 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Il1r1P13504 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Il1r1P13504 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Il1r1P13504 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Il1r1P13504 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Il1r1P13504 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Il1r1P13504 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Il1r1P13504 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Il1r1P13504 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Il1r1P13504 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Il1r1P13504 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Il1r1P13504 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Il1r1P13504 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Il1r1P13504 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms