Protein–RNA interactions for Protein: P12960

Cntn1, Contactin-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,020 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntn1P12960 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cntn1P12960 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cntn1P12960 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cntn1P12960 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cntn1P12960 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cntn1P12960 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cntn1P12960 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cntn1P12960 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cntn1P12960 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cntn1P12960 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cntn1P12960 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cntn1P12960 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cntn1P12960 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cntn1P12960 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cntn1P12960 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cntn1P12960 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cntn1P12960 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cntn1P12960 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cntn1P12960 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cntn1P12960 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Cntn1P12960 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cntn1P12960 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cntn1P12960 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cntn1P12960 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cntn1P12960 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cntn1P12960 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cntn1P12960 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cntn1P12960 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cntn1P12960 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Cntn1P12960 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cntn1P12960 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cntn1P12960 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cntn1P12960 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cntn1P12960 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cntn1P12960 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cntn1P12960 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cntn1P12960 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cntn1P12960 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cntn1P12960 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cntn1P12960 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cntn1P12960 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cntn1P12960 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cntn1P12960 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cntn1P12960 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cntn1P12960 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cntn1P12960 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cntn1P12960 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cntn1P12960 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cntn1P12960 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cntn1P12960 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cntn1P12960 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cntn1P12960 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cntn1P12960 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cntn1P12960 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cntn1P12960 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cntn1P12960 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cntn1P12960 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cntn1P12960 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cntn1P12960 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cntn1P12960 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cntn1P12960 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cntn1P12960 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cntn1P12960 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cntn1P12960 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cntn1P12960 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cntn1P12960 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Cntn1P12960 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cntn1P12960 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cntn1P12960 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cntn1P12960 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cntn1P12960 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cntn1P12960 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cntn1P12960 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cntn1P12960 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cntn1P12960 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cntn1P12960 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Cntn1P12960 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Cntn1P12960 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cntn1P12960 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cntn1P12960 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cntn1P12960 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cntn1P12960 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cntn1P12960 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cntn1P12960 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cntn1P12960 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cntn1P12960 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cntn1P12960 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cntn1P12960 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cntn1P12960 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cntn1P12960 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cntn1P12960 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cntn1P12960 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cntn1P12960 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cntn1P12960 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cntn1P12960 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Cntn1P12960 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cntn1P12960 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cntn1P12960 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cntn1P12960 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Cntn1P12960 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms