Protein–RNA interactions for Protein: P11688

Itga5, Integrin alpha-5, mousemouse

Predictions only

Length 1,053 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga5P11688 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Itga5P11688 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Itga5P11688 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Itga5P11688 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Itga5P11688 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Itga5P11688 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Itga5P11688 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Itga5P11688 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Itga5P11688 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Itga5P11688 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Itga5P11688 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Itga5P11688 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Itga5P11688 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Itga5P11688 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Itga5P11688 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Itga5P11688 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Itga5P11688 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Itga5P11688 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Itga5P11688 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Itga5P11688 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Itga5P11688 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Itga5P11688 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Itga5P11688 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Itga5P11688 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Itga5P11688 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Itga5P11688 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Itga5P11688 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Itga5P11688 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Itga5P11688 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Itga5P11688 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Itga5P11688 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Itga5P11688 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Itga5P11688 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Itga5P11688 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Itga5P11688 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Itga5P11688 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Itga5P11688 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Itga5P11688 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Itga5P11688 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Itga5P11688 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Itga5P11688 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Itga5P11688 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Itga5P11688 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Itga5P11688 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Itga5P11688 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Itga5P11688 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Itga5P11688 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Itga5P11688 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Itga5P11688 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Itga5P11688 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Itga5P11688 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC21.29■■□□□ 1
Itga5P11688 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Itga5P11688 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Itga5P11688 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Itga5P11688 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Itga5P11688 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Itga5P11688 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Itga5P11688 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Itga5P11688 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Itga5P11688 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Itga5P11688 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Itga5P11688 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Itga5P11688 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Itga5P11688 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Itga5P11688 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Itga5P11688 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Itga5P11688 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Itga5P11688 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Itga5P11688 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Itga5P11688 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Itga5P11688 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Itga5P11688 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Itga5P11688 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Itga5P11688 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Itga5P11688 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Itga5P11688 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Itga5P11688 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Itga5P11688 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Itga5P11688 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Itga5P11688 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Itga5P11688 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Itga5P11688 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Itga5P11688 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Itga5P11688 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Itga5P11688 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Itga5P11688 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Itga5P11688 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Itga5P11688 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Itga5P11688 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Itga5P11688 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Itga5P11688 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Itga5P11688 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Itga5P11688 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Itga5P11688 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Itga5P11688 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Itga5P11688 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Itga5P11688 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Itga5P11688 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Itga5P11688 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Itga5P11688 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.8 ms