Protein–RNA interactions for Protein: P11088

Flg, Filaggrin (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FlgP11088 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
FlgP11088 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
FlgP11088 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
FlgP11088 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
FlgP11088 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
FlgP11088 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
FlgP11088 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
FlgP11088 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
FlgP11088 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
FlgP11088 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
FlgP11088 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
FlgP11088 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
FlgP11088 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
FlgP11088 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
FlgP11088 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
FlgP11088 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
FlgP11088 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
FlgP11088 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
FlgP11088 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
FlgP11088 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
FlgP11088 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
FlgP11088 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
FlgP11088 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
FlgP11088 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
FlgP11088 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
FlgP11088 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
FlgP11088 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
FlgP11088 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
FlgP11088 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
FlgP11088 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
FlgP11088 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
FlgP11088 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
FlgP11088 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
FlgP11088 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
FlgP11088 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
FlgP11088 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
FlgP11088 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
FlgP11088 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
FlgP11088 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
FlgP11088 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
FlgP11088 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
FlgP11088 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
FlgP11088 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
FlgP11088 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
FlgP11088 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
FlgP11088 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
FlgP11088 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
FlgP11088 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
FlgP11088 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
FlgP11088 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
FlgP11088 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
FlgP11088 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
FlgP11088 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
FlgP11088 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
FlgP11088 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
FlgP11088 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
FlgP11088 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
FlgP11088 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
FlgP11088 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
FlgP11088 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
FlgP11088 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
FlgP11088 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
FlgP11088 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
FlgP11088 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
FlgP11088 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
FlgP11088 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
FlgP11088 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
FlgP11088 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
FlgP11088 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
FlgP11088 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
FlgP11088 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
FlgP11088 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
FlgP11088 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
FlgP11088 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
FlgP11088 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
FlgP11088 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
FlgP11088 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
FlgP11088 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
FlgP11088 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC27.05■■□□□ 1.92
FlgP11088 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
FlgP11088 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
FlgP11088 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
FlgP11088 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
FlgP11088 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
FlgP11088 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
FlgP11088 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
FlgP11088 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
FlgP11088 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
FlgP11088 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
FlgP11088 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
FlgP11088 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
FlgP11088 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
FlgP11088 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
FlgP11088 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
FlgP11088 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
FlgP11088 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
FlgP11088 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
FlgP11088 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
FlgP11088 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
FlgP11088 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms