Protein–RNA interactions for Protein: P10889

Cxcl2, C-X-C motif chemokine 2, mousemouse

Predictions only

Length 100 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcl2P10889 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Cxcl2P10889 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Cxcl2P10889 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Cxcl2P10889 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Cxcl2P10889 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Cxcl2P10889 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Cxcl2P10889 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Cxcl2P10889 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Cxcl2P10889 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Cxcl2P10889 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Cxcl2P10889 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Cxcl2P10889 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Cxcl2P10889 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Cxcl2P10889 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Cxcl2P10889 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Cxcl2P10889 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Cxcl2P10889 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Cxcl2P10889 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Cxcl2P10889 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Cxcl2P10889 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Cxcl2P10889 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Cxcl2P10889 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Cxcl2P10889 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Cxcl2P10889 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Cxcl2P10889 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Cxcl2P10889 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Cxcl2P10889 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Cxcl2P10889 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Cxcl2P10889 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Cxcl2P10889 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cxcl2P10889 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cxcl2P10889 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cxcl2P10889 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cxcl2P10889 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cxcl2P10889 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cxcl2P10889 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cxcl2P10889 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cxcl2P10889 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cxcl2P10889 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cxcl2P10889 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cxcl2P10889 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cxcl2P10889 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cxcl2P10889 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cxcl2P10889 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cxcl2P10889 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cxcl2P10889 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cxcl2P10889 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cxcl2P10889 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cxcl2P10889 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cxcl2P10889 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cxcl2P10889 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cxcl2P10889 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cxcl2P10889 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Cxcl2P10889 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cxcl2P10889 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cxcl2P10889 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cxcl2P10889 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cxcl2P10889 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cxcl2P10889 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cxcl2P10889 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cxcl2P10889 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Cxcl2P10889 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cxcl2P10889 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Cxcl2P10889 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cxcl2P10889 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Cxcl2P10889 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cxcl2P10889 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cxcl2P10889 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cxcl2P10889 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cxcl2P10889 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cxcl2P10889 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cxcl2P10889 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.21■□□□□ 0.66
Cxcl2P10889 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cxcl2P10889 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cxcl2P10889 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cxcl2P10889 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cxcl2P10889 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cxcl2P10889 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cxcl2P10889 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cxcl2P10889 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cxcl2P10889 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cxcl2P10889 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cxcl2P10889 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cxcl2P10889 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cxcl2P10889 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cxcl2P10889 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cxcl2P10889 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cxcl2P10889 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Cxcl2P10889 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cxcl2P10889 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cxcl2P10889 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cxcl2P10889 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cxcl2P10889 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cxcl2P10889 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cxcl2P10889 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cxcl2P10889 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cxcl2P10889 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cxcl2P10889 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cxcl2P10889 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cxcl2P10889 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.8 ms