Protein–RNA interactions for Protein: P10287

Cdh3, Cadherin-3, mousemouse

Predictions only

Length 822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdh3P10287 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cdh3P10287 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cdh3P10287 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cdh3P10287 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cdh3P10287 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cdh3P10287 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cdh3P10287 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cdh3P10287 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cdh3P10287 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cdh3P10287 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cdh3P10287 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cdh3P10287 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cdh3P10287 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cdh3P10287 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cdh3P10287 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Cdh3P10287 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cdh3P10287 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cdh3P10287 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cdh3P10287 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cdh3P10287 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cdh3P10287 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cdh3P10287 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cdh3P10287 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cdh3P10287 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cdh3P10287 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cdh3P10287 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cdh3P10287 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cdh3P10287 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cdh3P10287 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cdh3P10287 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cdh3P10287 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cdh3P10287 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cdh3P10287 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cdh3P10287 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cdh3P10287 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Cdh3P10287 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cdh3P10287 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cdh3P10287 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cdh3P10287 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cdh3P10287 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cdh3P10287 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cdh3P10287 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cdh3P10287 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cdh3P10287 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cdh3P10287 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cdh3P10287 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cdh3P10287 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cdh3P10287 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Cdh3P10287 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cdh3P10287 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cdh3P10287 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cdh3P10287 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Cdh3P10287 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cdh3P10287 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cdh3P10287 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cdh3P10287 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cdh3P10287 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cdh3P10287 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cdh3P10287 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cdh3P10287 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cdh3P10287 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cdh3P10287 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cdh3P10287 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cdh3P10287 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cdh3P10287 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cdh3P10287 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cdh3P10287 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cdh3P10287 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cdh3P10287 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cdh3P10287 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cdh3P10287 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cdh3P10287 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cdh3P10287 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cdh3P10287 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cdh3P10287 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cdh3P10287 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cdh3P10287 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cdh3P10287 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cdh3P10287 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cdh3P10287 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Cdh3P10287 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Cdh3P10287 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Cdh3P10287 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Cdh3P10287 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Cdh3P10287 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cdh3P10287 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Cdh3P10287 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cdh3P10287 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cdh3P10287 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cdh3P10287 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cdh3P10287 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cdh3P10287 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cdh3P10287 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cdh3P10287 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cdh3P10287 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.27■■□□□ 1
Cdh3P10287 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cdh3P10287 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Cdh3P10287 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cdh3P10287 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cdh3P10287 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.6 ms