Protein–RNA interactions for Protein: P0C0A3

Chmp6, Charged multivesicular body protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp6P0C0A3 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Chmp6P0C0A3 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Chmp6P0C0A3 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
Chmp6P0C0A3 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Chmp6P0C0A3 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Chmp6P0C0A3 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Chmp6P0C0A3 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Chmp6P0C0A3 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Chmp6P0C0A3 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Chmp6P0C0A3 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Chmp6P0C0A3 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Chmp6P0C0A3 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Chmp6P0C0A3 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Chmp6P0C0A3 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Chmp6P0C0A3 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Chmp6P0C0A3 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Chmp6P0C0A3 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Chmp6P0C0A3 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Chmp6P0C0A3 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Chmp6P0C0A3 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Chmp6P0C0A3 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Chmp6P0C0A3 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Chmp6P0C0A3 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Chmp6P0C0A3 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Chmp6P0C0A3 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Chmp6P0C0A3 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Chmp6P0C0A3 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Chmp6P0C0A3 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Chmp6P0C0A3 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Chmp6P0C0A3 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Chmp6P0C0A3 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Chmp6P0C0A3 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Chmp6P0C0A3 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Chmp6P0C0A3 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Chmp6P0C0A3 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Chmp6P0C0A3 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Chmp6P0C0A3 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Chmp6P0C0A3 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Chmp6P0C0A3 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Chmp6P0C0A3 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Chmp6P0C0A3 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Chmp6P0C0A3 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Chmp6P0C0A3 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Chmp6P0C0A3 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Chmp6P0C0A3 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Chmp6P0C0A3 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Chmp6P0C0A3 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Chmp6P0C0A3 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Chmp6P0C0A3 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Chmp6P0C0A3 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Chmp6P0C0A3 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Chmp6P0C0A3 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Chmp6P0C0A3 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Chmp6P0C0A3 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Chmp6P0C0A3 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Chmp6P0C0A3 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Chmp6P0C0A3 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Chmp6P0C0A3 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Chmp6P0C0A3 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Chmp6P0C0A3 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Chmp6P0C0A3 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Chmp6P0C0A3 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Chmp6P0C0A3 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Chmp6P0C0A3 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Chmp6P0C0A3 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Chmp6P0C0A3 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Chmp6P0C0A3 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Chmp6P0C0A3 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Chmp6P0C0A3 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Chmp6P0C0A3 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Chmp6P0C0A3 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Chmp6P0C0A3 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Chmp6P0C0A3 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Chmp6P0C0A3 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Chmp6P0C0A3 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Chmp6P0C0A3 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Chmp6P0C0A3 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Chmp6P0C0A3 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Chmp6P0C0A3 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Chmp6P0C0A3 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Chmp6P0C0A3 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Chmp6P0C0A3 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Chmp6P0C0A3 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Chmp6P0C0A3 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Chmp6P0C0A3 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Chmp6P0C0A3 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Chmp6P0C0A3 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Chmp6P0C0A3 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Chmp6P0C0A3 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Chmp6P0C0A3 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Chmp6P0C0A3 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Chmp6P0C0A3 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Chmp6P0C0A3 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Chmp6P0C0A3 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
Chmp6P0C0A3 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Chmp6P0C0A3 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Chmp6P0C0A3 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Chmp6P0C0A3 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Chmp6P0C0A3 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Chmp6P0C0A3 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms