Protein–RNA interactions for Protein: P09631

Hoxa9, Homeobox protein Hox-A9, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa9P09631 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Hoxa9P09631 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Hoxa9P09631 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Hoxa9P09631 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Hoxa9P09631 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Hoxa9P09631 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Hoxa9P09631 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Hoxa9P09631 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Hoxa9P09631 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Hoxa9P09631 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Hoxa9P09631 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Hoxa9P09631 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Hoxa9P09631 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Hoxa9P09631 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Hoxa9P09631 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Hoxa9P09631 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Hoxa9P09631 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Hoxa9P09631 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Hoxa9P09631 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Hoxa9P09631 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Hoxa9P09631 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Hoxa9P09631 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Hoxa9P09631 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Hoxa9P09631 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Hoxa9P09631 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Hoxa9P09631 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Hoxa9P09631 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Hoxa9P09631 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Hoxa9P09631 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Hoxa9P09631 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Hoxa9P09631 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Hoxa9P09631 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Hoxa9P09631 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Hoxa9P09631 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Hoxa9P09631 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Hoxa9P09631 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Hoxa9P09631 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Hoxa9P09631 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Hoxa9P09631 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Hoxa9P09631 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Hoxa9P09631 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Hoxa9P09631 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Hoxa9P09631 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Hoxa9P09631 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Hoxa9P09631 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Hoxa9P09631 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Hoxa9P09631 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Hoxa9P09631 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Hoxa9P09631 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Hoxa9P09631 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Hoxa9P09631 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Hoxa9P09631 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Hoxa9P09631 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Hoxa9P09631 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Hoxa9P09631 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Hoxa9P09631 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Hoxa9P09631 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Hoxa9P09631 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Hoxa9P09631 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Hoxa9P09631 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Hoxa9P09631 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Hoxa9P09631 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Hoxa9P09631 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Hoxa9P09631 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Hoxa9P09631 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Hoxa9P09631 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Hoxa9P09631 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Hoxa9P09631 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Hoxa9P09631 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Hoxa9P09631 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
Hoxa9P09631 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Hoxa9P09631 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Hoxa9P09631 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Hoxa9P09631 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Hoxa9P09631 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Hoxa9P09631 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Hoxa9P09631 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Hoxa9P09631 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Hoxa9P09631 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Hoxa9P09631 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Hoxa9P09631 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Hoxa9P09631 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Hoxa9P09631 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Hoxa9P09631 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Hoxa9P09631 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Hoxa9P09631 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Hoxa9P09631 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Hoxa9P09631 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Hoxa9P09631 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Hoxa9P09631 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Hoxa9P09631 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Hoxa9P09631 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Hoxa9P09631 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Hoxa9P09631 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Hoxa9P09631 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Hoxa9P09631 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Hoxa9P09631 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Hoxa9P09631 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Hoxa9P09631 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Hoxa9P09631 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.8 ms