Protein–RNA interactions for Protein: P09024

Hoxb7, Homeobox protein Hox-B7, mousemouse

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb7P09024 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC31.68■■■□□ 2.66
Hoxb7P09024 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.68■■■□□ 2.66
Hoxb7P09024 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.67■■■□□ 2.66
Hoxb7P09024 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
Hoxb7P09024 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC31.67■■■□□ 2.66
Hoxb7P09024 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC31.67■■■□□ 2.66
Hoxb7P09024 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC31.66■■■□□ 2.66
Hoxb7P09024 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
Hoxb7P09024 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
Hoxb7P09024 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC31.65■■■□□ 2.66
Hoxb7P09024 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
Hoxb7P09024 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
Hoxb7P09024 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.65
Hoxb7P09024 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
Hoxb7P09024 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.62■■■□□ 2.65
Hoxb7P09024 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC31.62■■■□□ 2.65
Hoxb7P09024 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
Hoxb7P09024 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC31.61■■■□□ 2.65
Hoxb7P09024 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
Hoxb7P09024 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
Hoxb7P09024 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
Hoxb7P09024 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
Hoxb7P09024 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC31.58■■■□□ 2.65
Hoxb7P09024 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
Hoxb7P09024 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.58■■■□□ 2.65
Hoxb7P09024 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
Hoxb7P09024 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC31.57■■■□□ 2.64
Hoxb7P09024 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.56■■■□□ 2.64
Hoxb7P09024 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
Hoxb7P09024 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
Hoxb7P09024 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC31.53■■■□□ 2.64
Hoxb7P09024 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
Hoxb7P09024 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
Hoxb7P09024 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
Hoxb7P09024 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
Hoxb7P09024 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
Hoxb7P09024 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
Hoxb7P09024 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
Hoxb7P09024 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC31.49■■■□□ 2.63
Hoxb7P09024 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
Hoxb7P09024 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
Hoxb7P09024 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
Hoxb7P09024 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.48■■■□□ 2.63
Hoxb7P09024 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC31.47■■■□□ 2.63
Hoxb7P09024 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC31.47■■■□□ 2.63
Hoxb7P09024 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
Hoxb7P09024 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.62
Hoxb7P09024 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
Hoxb7P09024 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC31.43■■■□□ 2.62
Hoxb7P09024 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC31.43■■■□□ 2.62
Hoxb7P09024 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
Hoxb7P09024 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.42■■■□□ 2.62
Hoxb7P09024 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
Hoxb7P09024 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC31.42■■■□□ 2.62
Hoxb7P09024 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
Hoxb7P09024 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
Hoxb7P09024 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
Hoxb7P09024 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
Hoxb7P09024 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
Hoxb7P09024 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
Hoxb7P09024 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
Hoxb7P09024 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
Hoxb7P09024 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC31.39■■■□□ 2.62
Hoxb7P09024 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
Hoxb7P09024 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
Hoxb7P09024 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC31.37■■■□□ 2.61
Hoxb7P09024 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
Hoxb7P09024 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
Hoxb7P09024 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
Hoxb7P09024 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
Hoxb7P09024 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC31.35■■■□□ 2.61
Hoxb7P09024 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
Hoxb7P09024 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC31.34■■■□□ 2.61
Hoxb7P09024 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
Hoxb7P09024 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
Hoxb7P09024 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
Hoxb7P09024 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
Hoxb7P09024 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC31.32■■■□□ 2.6
Hoxb7P09024 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
Hoxb7P09024 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
Hoxb7P09024 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
Hoxb7P09024 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC31.31■■■□□ 2.6
Hoxb7P09024 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC31.3■■■□□ 2.6
Hoxb7P09024 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC31.29■■■□□ 2.6
Hoxb7P09024 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC31.29■■■□□ 2.6
Hoxb7P09024 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
Hoxb7P09024 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
Hoxb7P09024 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
Hoxb7P09024 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
Hoxb7P09024 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC31.27■■■□□ 2.6
Hoxb7P09024 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC31.27■■■□□ 2.6
Hoxb7P09024 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC31.27■■■□□ 2.6
Hoxb7P09024 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
Hoxb7P09024 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC31.27■■■□□ 2.6
Hoxb7P09024 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.6
Hoxb7P09024 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC31.26■■■□□ 2.59
Hoxb7P09024 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC31.26■■■□□ 2.59
Hoxb7P09024 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC31.25■■■□□ 2.59
Hoxb7P09024 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
Hoxb7P09024 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms